More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1879 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2836 aa  5395    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  40.41 
 
 		 4800 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 1884 aa  526  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  39.43 
 
 		 2911 aa  353  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.59 
 
 		 2097 aa  307  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.59 
 
 		 1145 aa  263  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.85 
 
 		 833 aa  221  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.02 
 
 		 1079 aa  221  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.85 
 
 		 4334 aa  215  9e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 1400 aa  210  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.22 
 
 		 1544 aa  206  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 		 3954 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 		 1072 aa  203  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.11 
 
 		 1390 aa  201  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 2678 aa  179  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  30.75 
 
 		 1286 aa  174  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  28.59 
 
 		 2954 aa  171  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  31.43 
 
 		 1582 aa  171  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.49 
 
 		 1156 aa  169  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.96 
 
 		 556 aa  169  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40.23 
 
 		 745 aa  160  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.49 
 
 		 1499 aa  159  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.51 
 
 		 965 aa  159  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 1855 aa  158  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.54 
 
 		 946 aa  157  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 		 1628 aa  155  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 1112 aa  152  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.69 
 
 		 1279 aa  149  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.53 
 
 		 1363 aa  147  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.2 
 
 		 1424 aa  144  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.23 
 
 		 2467 aa  144  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.63 
 
 		 2775 aa  143  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  41.47 
 
 		 648 aa  141  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.6 
 
 		 1415 aa  140  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.42 
 
 		 2133 aa  139  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.81 
 
 		 2807 aa  138  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 		 759 aa  136  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.18 
 
 		 2689 aa  130  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  37.81 
 
 		 1112 aa  128  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.65 
 
 		 860 aa  127  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.41 
 
 		 3598 aa  127  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.78 
 
 		 1236 aa  125  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 		 1864 aa  123  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 1534 aa  124  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  28.45 
 
 		 1532 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  38.42 
 
 		 3619 aa  121  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.06 
 
 		 2245 aa  121  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  31.4 
 
 		 1712 aa  120  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.15 
 
 		 1895 aa  119  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.71 
 
 		 3619 aa  119  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.81 
 
 		 833 aa  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.82 
 
 		 4687 aa  115  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  26.92 
 
 		 3026 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36 
 
 		 3209 aa  114  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.56 
 
 		 595 aa  113  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.37 
 
 		 824 aa  113  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  28.96 
 
 		 1213 aa  110  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 820 aa  110  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.18 
 
 		 3427 aa  110  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.82 
 
 		 4798 aa  109  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  28.16 
 
 		 764 aa  109  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.16 
 
 		 855 aa  109  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  39.85 
 
 		 329 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  39.85 
 
 		 329 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  36.51 
 
 		 3608 aa  108  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  27.26 
 
 		 1480 aa  107  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  29.54 
 
 		 1287 aa  106  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  33.58 
 
 		 2950 aa  105  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.45 
 
 		 2198 aa  105  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 		 1795 aa  105  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.04 
 
 		 2105 aa  103  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  28.57 
 
 		 1134 aa  103  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  47.8 
 
 		 677 aa  103  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.81 
 
 		 1164 aa  103  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.99 
 
 		 437 aa  102  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.16 
 
 		 2667 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.26 
 
 		 1180 aa  102  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.76 
 
 		 1197 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.71 
 
 		 613 aa  100  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.43 
 
 		 437 aa  99.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  29.36 
 
 		 1764 aa  97.1  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.44 
 
 		 980 aa  96.7  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.92 
 
 		 959 aa  96.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  37.41 
 
 		 1883 aa  96.3  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  34.55 
 
 		 623 aa  95.9  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.03 
 
 		 393 aa  95.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  28.88 
 
 		 982 aa  94.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.42 
 
 		 387 aa  93.6  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.64 
 
 		 2145 aa  93.2  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  35.41 
 
 		 795 aa  92.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.33 
 
 		 1168 aa  91.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  28.55 
 
 		 928 aa  91.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.06 
 
 		 942 aa  90.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.19 
 
 		 9867 aa  90.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  35.86 
 
 		 813 aa  89.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  28.95 
 
 		 932 aa  89.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  28.36 
 
 		 889 aa  89.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  37.56 
 
 		 460 aa  89.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  35.28 
 
 		 396 aa  89.4  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.07 
 
 		 518 aa  89  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>