More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4306 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 682 aa  1275    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  38 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.23 
 
 		 1279 aa  163  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.93 
 
 		 1079 aa  151  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.61 
 
 		 1363 aa  148  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.38 
 
 		 946 aa  143  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  30.03 
 
 		 1400 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.55 
 
 		 4334 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.72 
 
 		 2954 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.45 
 
 		 1534 aa  126  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.39 
 
 		 1895 aa  125  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.37 
 
 		 595 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.55 
 
 		 3954 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  28.85 
 
 		 860 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.37 
 
 		 1855 aa  115  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.05 
 
 		 1156 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.65 
 
 		 965 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.05 
 
 		 820 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.28 
 
 		 1499 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 4800 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  33.66 
 
 		 795 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 		 1795 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.72 
 
 		 1532 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  27.27 
 
 		 1164 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.01 
 
 		 824 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 		 1884 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  26.7 
 
 		 1480 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.81 
 
 		 2667 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.27 
 
 		 2911 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 		 928 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  27.59 
 
 		 928 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.62 
 
 		 4798 aa  101  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  28.41 
 
 		 589 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.38 
 
 		 1180 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.76 
 
 		 589 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.37 
 
 		 3209 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.11 
 
 		 2105 aa  99  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 		 526 aa  99  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  28.59 
 
 		 2133 aa  97.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.34 
 
 		 2689 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  28.14 
 
 		 932 aa  97.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  25.8 
 
 		 3598 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 491 aa  95.5  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.7 
 
 		 1197 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.92 
 
 		 1145 aa  95.1  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  24.24 
 
 		 2245 aa  94.7  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  30.37 
 
 		 623 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.88 
 
 		 4723 aa  94.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.54 
 
 		 855 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  26.91 
 
 		 1286 aa  94  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  33.75 
 
 		 387 aa  94  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.43 
 
 		 2107 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.19 
 
 		 1544 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.62 
 
 		 2678 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.65 
 
 		 556 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  29.27 
 
 		 959 aa  92.8  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  27.78 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35 
 
 		 980 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.09 
 
 		 3619 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 387 aa  91.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.63 
 
 		 1415 aa  90.5  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 329 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 329 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  29.13 
 
 		 833 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1424 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.99 
 
 		 2775 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.05 
 
 		 3427 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  31.49 
 
 		 3619 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  28.55 
 
 		 1582 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  38.63 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  27.86 
 
 		 1383 aa  89  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  33.83 
 
 		 942 aa  87  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.47 
 
 		 437 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.75 
 
 		 1236 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.7 
 
 		 2807 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.17 
 
 		 1287 aa  84  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1306 aa  83.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.34 
 
 		 2198 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.84 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  34.51 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  27.98 
 
 		 1839 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.92 
 
 		 4687 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.91 
 
 		 1814 aa  81.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  28.19 
 
 		 889 aa  80.9  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  37.05 
 
 		 1043 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  35.09 
 
 		 767 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.13 
 
 		 588 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  36.09 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.08 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  33.07 
 
 		 610 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.04 
 
 		 2097 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  28.78 
 
 		 998 aa  79  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  29.72 
 
 		 14829 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.02 
 
 		 1019 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.62 
 
 		 833 aa  78.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  26.07 
 
 		 1168 aa  78.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>