More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  68.13 
 
 		 901 aa  1067    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  100 
 
 		 889 aa  1670    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  63.25 
 
 		 858 aa  917    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  57.52 
 
 		 1839 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  51.15 
 
 		 1168 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  60 
 
 		 998 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  58.21 
 
 		 1403 aa  470  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  52.87 
 
 		 856 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  54.2 
 
 		 874 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  56.89 
 
 		 998 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  39.83 
 
 		 515 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  33.81 
 
 		 2807 aa  277  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  38.13 
 
 		 8871 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  47.42 
 
 		 1610 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  45.48 
 
 		 1610 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 		 495 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 		 2198 aa  228  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  41.25 
 
 		 1933 aa  224  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  31.19 
 
 		 2467 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  54.76 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  43.23 
 
 		 340 aa  184  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.63 
 
 		 665 aa  183  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1100 aa  181  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  63.03 
 
 		 553 aa  175  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  40.11 
 
 		 864 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  33.71 
 
 		 3563 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.82 
 
 		 1180 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  31.89 
 
 		 429 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.68 
 
 		 1480 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1280 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.8 
 
 		 1164 aa  106  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1027 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 		 1079 aa  102  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.82 
 
 		 1183 aa  100  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.21 
 
 		 1499 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.95 
 
 		 855 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.5 
 
 		 1156 aa  97.8  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  30 
 
 		 1991 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.76 
 
 		 2954 aa  96.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  30.95 
 
 		 3598 aa  95.5  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 820 aa  95.5  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.29 
 
 		 1176 aa  95.1  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.78 
 
 		 1884 aa  94.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  26.56 
 
 		 549 aa  94.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.39 
 
 		 4334 aa  91.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  28.36 
 
 		 2836 aa  90.1  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.27 
 
 		 1019 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.48 
 
 		 5769 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  28.98 
 
 		 1400 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.64 
 
 		 3954 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.44 
 
 		 3026 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28.68 
 
 		 3209 aa  85.5  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28 
 
 		 1197 aa  84.7  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.81 
 
 		 2245 aa  84.3  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.18 
 
 		 833 aa  83.2  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.21 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  29.85 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  28.18 
 
 		 942 aa  80.9  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.24 
 
 		 2689 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  31.44 
 
 		 569 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.54 
 
 		 682 aa  80.1  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 946 aa  79.7  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  30.65 
 
 		 503 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.61 
 
 		 1055 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 621 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  31.02 
 
 		 1895 aa  78.2  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  29.75 
 
 		 932 aa  78.2  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  37.14 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  33.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  32.45 
 
 		 999 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  33.11 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  32.72 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  32.72 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  27.27 
 
 		 928 aa  75.5  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.66 
 
 		 2911 aa  75.5  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.55 
 
 		 1855 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.43 
 
 		 4798 aa  73.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.31 
 
 		 2701 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.09 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  47.62 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  28.63 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1068 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  50.6 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1306 aa  71.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  30.95 
 
 		 4687 aa  71.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  24.22 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  41.26 
 
 		 221 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  28.67 
 
 		 928 aa  70.1  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  36.54 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  45.78 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  38.99 
 
 		 4678 aa  69.3  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  28.99 
 
 		 768 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.38 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  45.78 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  32.32 
 
 		 2345 aa  68.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>