More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1287 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  100 
 
 		 610 aa  1145    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 		 946 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 1400 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 		 1287 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.63 
 
 		 2105 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.18 
 
 		 2667 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.76 
 
 		 2145 aa  121  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  39.78 
 
 		 613 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.22 
 
 		 3427 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 1895 aa  117  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  34.74 
 
 		 387 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.5 
 
 		 1164 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.17 
 
 		 1532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.53 
 
 		 1534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.07 
 
 		 950 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.73 
 
 		 595 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.37 
 
 		 2954 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 526 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 4334 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.85 
 
 		 833 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.07 
 
 		 2668 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.31 
 
 		 1795 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.44 
 
 		 1363 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.86 
 
 		 980 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.6 
 
 		 965 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.25 
 
 		 491 aa  107  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 		 824 aa  105  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  31.89 
 
 		 3954 aa  104  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.2 
 
 		 1279 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 4800 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  35.8 
 
 		 589 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.05 
 
 		 518 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  31.64 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.96 
 
 		 2678 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.38 
 
 		 2689 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 437 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.24 
 
 		 1499 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  37.01 
 
 		 341 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.19 
 
 		 1855 aa  99.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 393 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 		 357 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.64 
 
 		 795 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.95 
 
 		 1079 aa  97.8  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.68 
 
 		 4687 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.26 
 
 		 982 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.3 
 
 		 2775 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  31.72 
 
 		 1424 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 		 387 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 		 361 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.4 
 
 		 1544 aa  94  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 1043 aa  94  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 		 361 aa  94  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 329 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 329 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.07 
 
 		 9867 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.44 
 
 		 1156 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34.98 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 		 396 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  37.3 
 
 		 767 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.51 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.26 
 
 		 833 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  33.43 
 
 		 623 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.59 
 
 		 1883 aa  90.5  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  30.39 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  41.32 
 
 		 724 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.25 
 
 		 260 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.76 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  33.02 
 
 		 561 aa  88.6  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.39 
 
 		 361 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.05 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.33 
 
 		 813 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  37.57 
 
 		 615 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.6 
 
 		 860 aa  87.8  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 734 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.93 
 
 		 3209 aa  87  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  39.27 
 
 		 245 aa  86.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  34.74 
 
 		 850 aa  86.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  34.47 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.24 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  35.94 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  28.66 
 
 		 741 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.45 
 
 		 1963 aa  84  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  42.86 
 
 		 5020 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  30 
 
 		 769 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 639 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 257 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.17 
 
 		 959 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  40.71 
 
 		 606 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.68 
 
 		 1145 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  31 
 
 		 728 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  38.53 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.7 
 
 		 2911 aa  82.8  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  46.85 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  32.12 
 
 		 682 aa  80.9  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  30.68 
 
 		 3608 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  53.01 
 
 		 507 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>