More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2502 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
361 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  84.49 
 
 
361 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  84.21 
 
 
361 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  49.3 
 
 
2796 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  61.85 
 
 
363 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  63.43 
 
 
341 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  52.02 
 
 
2342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  51.01 
 
 
2342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  65.14 
 
 
341 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  73.74 
 
 
1632 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  73.74 
 
 
1806 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.2 
 
 
980 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.71 
 
 
460 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  45.59 
 
 
260 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 
946 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 
1287 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  43.94 
 
 
595 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  39.38 
 
 
833 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.95 
 
 
1424 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  43.65 
 
 
491 aa  113  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  45.6 
 
 
2954 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  48.28 
 
 
849 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.71 
 
 
1895 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  46.07 
 
 
1400 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  43.35 
 
 
824 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.09 
 
 
1279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.4 
 
 
3427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.53 
 
 
2105 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  42.78 
 
 
639 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.89 
 
 
1795 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.39 
 
 
686 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.22 
 
 
1963 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  47.79 
 
 
678 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  41.62 
 
 
613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.21 
 
 
460 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  43.09 
 
 
615 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  41.76 
 
 
795 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.64 
 
 
4334 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.29 
 
 
2668 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  49.07 
 
 
561 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.87 
 
 
1164 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  44.71 
 
 
3954 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
243 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  43.55 
 
 
606 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 
1534 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 
9867 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.2 
 
 
1532 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.12 
 
 
1236 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
327 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.81 
 
 
1016 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  41.62 
 
 
5171 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.77 
 
 
1363 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.04 
 
 
1883 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  39.77 
 
 
232 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.63 
 
 
982 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.38 
 
 
2667 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.97 
 
 
588 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  43.55 
 
 
746 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  47.62 
 
 
872 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 
387 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  51.08 
 
 
3619 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  43.98 
 
 
1197 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  51.08 
 
 
3619 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  63.89 
 
 
120 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.97 
 
 
950 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.13 
 
 
2678 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  41.45 
 
 
2145 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  39.62 
 
 
2689 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.36 
 
 
2911 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
2885 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  44.14 
 
 
1152 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  42.41 
 
 
385 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  44.14 
 
 
1152 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  44.85 
 
 
938 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  40.37 
 
 
387 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.11 
 
 
709 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.66 
 
 
813 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 
572 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 
729 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 
219 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  57.83 
 
 
115 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  35.71 
 
 
556 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  41.15 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  34.84 
 
 
717 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  37.2 
 
 
742 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
257 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  39.72 
 
 
4798 aa  93.6  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  36.15 
 
 
437 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  38.92 
 
 
850 aa  92.8  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  39.13 
 
 
1544 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  45.52 
 
 
679 aa  92.8  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  43.48 
 
 
582 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
965 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  45.22 
 
 
757 aa  92.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 
437 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  44.52 
 
 
724 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  56.1 
 
 
227 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  45.14 
 
 
585 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>