More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0793 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
795 aa  1576    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40.8 
 
 
769 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  50.82 
 
 
741 aa  301  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  50.82 
 
 
734 aa  300  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.44 
 
 
1279 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.07 
 
 
946 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.14 
 
 
1795 aa  170  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.42 
 
 
3427 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.53 
 
 
2678 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  38.29 
 
 
2105 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.13 
 
 
595 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  35.51 
 
 
2954 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.39 
 
 
2911 aa  154  8.999999999999999e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.32 
 
 
2775 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.37 
 
 
1164 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.94 
 
 
1895 aa  150  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  36.84 
 
 
1363 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 
1534 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.41 
 
 
3954 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.94 
 
 
2667 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.12 
 
 
4334 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.06 
 
 
4687 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.4 
 
 
1400 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
1532 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.51 
 
 
980 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 
1079 aa  140  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 
526 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.42 
 
 
2689 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  34.39 
 
 
1287 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.18 
 
 
556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.41 
 
 
4800 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.84 
 
 
1884 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  35.99 
 
 
833 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.51 
 
 
588 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.34 
 
 
1544 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  38.56 
 
 
393 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.53 
 
 
518 aa  129  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.26 
 
 
1424 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.19 
 
 
1072 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.48 
 
 
589 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.3 
 
 
833 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.61 
 
 
341 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  38.25 
 
 
1855 aa  125  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.94 
 
 
3619 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  34.8 
 
 
965 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.52 
 
 
491 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  31.4 
 
 
3619 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.25 
 
 
437 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.37 
 
 
589 aa  121  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  41.71 
 
 
460 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  30.28 
 
 
613 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.65 
 
 
361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.65 
 
 
361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 
9867 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  37.93 
 
 
850 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 
824 aa  119  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  40.17 
 
 
757 aa  119  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.77 
 
 
860 aa  119  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  32.03 
 
 
1112 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.08 
 
 
421 aa  118  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.84 
 
 
1156 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  44.39 
 
 
355 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.76 
 
 
1145 aa  117  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.17 
 
 
709 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 
1963 aa  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 
341 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  32.02 
 
 
820 aa  117  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 
724 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  32.71 
 
 
942 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.77 
 
 
745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.1 
 
 
1016 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 
437 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 
982 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.99 
 
 
1499 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.13 
 
 
1236 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.23 
 
 
1112 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.16 
 
 
3209 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  35.03 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 
260 aa  113  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  35.58 
 
 
363 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
219 aa  111  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  36.32 
 
 
742 aa  111  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  41.04 
 
 
950 aa  111  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.16 
 
 
2097 aa  111  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  29.23 
 
 
3608 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.16 
 
 
813 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  33.66 
 
 
682 aa  110  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.95 
 
 
4798 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 
357 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  36.17 
 
 
928 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.76 
 
 
361 aa  109  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  35.85 
 
 
2145 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 
232 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  36.45 
 
 
273 aa  107  6e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 
639 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  37.15 
 
 
1650 aa  107  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  39.29 
 
 
717 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  39.27 
 
 
5171 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  50.72 
 
 
280 aa  107  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>