More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2335 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  58.85 
 
 		 3954 aa  963    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  87.76 
 
 		 2133 aa  883    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2198 aa  4189    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  80.19 
 
 		 2807 aa  616  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  46.16 
 
 		 2467 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  64.3 
 
 		 1933 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.32 
 
 		 1415 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  60.29 
 
 		 2954 aa  345  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 907 aa  312  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  47.83 
 
 		 768 aa  308  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 		 851 aa  305  7.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  34.01 
 
 		 901 aa  300  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  49.6 
 
 		 3209 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.66 
 
 		 4334 aa  281  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  34.94 
 
 		 889 aa  274  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  39.64 
 
 		 1764 aa  261  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  46.93 
 
 		 395 aa  261  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  46.78 
 
 		 1855 aa  260  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  50.47 
 
 		 395 aa  259  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  33.46 
 
 		 858 aa  256  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  39.73 
 
 		 1134 aa  241  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  50.74 
 
 		 2701 aa  236  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 2097 aa  233  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  43.42 
 
 		 8871 aa  232  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  40.89 
 
 		 1133 aa  226  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  36.83 
 
 		 3026 aa  208  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  55.6 
 
 		 1029 aa  206  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  55.6 
 
 		 1029 aa  206  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  40.05 
 
 		 3608 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.31 
 
 		 3619 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1100 aa  190  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.08 
 
 		 3619 aa  186  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  41.78 
 
 		 1534 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  37.34 
 
 		 1610 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.52 
 
 		 824 aa  174  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.96 
 
 		 2950 aa  172  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 		 1532 aa  169  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.54 
 
 		 1610 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.57 
 
 		 1197 aa  161  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  39.02 
 
 		 665 aa  161  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.23 
 
 		 820 aa  159  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 		 1079 aa  155  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 503 aa  154  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 462 aa  154  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 503 aa  154  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.61 
 
 		 1145 aa  151  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.57 
 
 		 2911 aa  151  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.15 
 
 		 946 aa  146  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 864 aa  142  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.1 
 
 		 833 aa  139  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.79 
 
 		 745 aa  137  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.73 
 
 		 2678 aa  135  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  37.81 
 
 		 1390 aa  135  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  39.15 
 
 		 535 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  41.2 
 
 		 727 aa  134  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 1213 aa  134  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.06 
 
 		 648 aa  132  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.64 
 
 		 574 aa  130  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.27 
 
 		 1582 aa  129  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  32.96 
 
 		 535 aa  128  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.96 
 
 		 475 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  31.59 
 
 		 429 aa  123  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.07 
 
 		 556 aa  122  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.23 
 
 		 3563 aa  122  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  43.98 
 
 		 1650 aa  119  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.78 
 
 		 2775 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 		 448 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 467 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.92 
 
 		 1499 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.26 
 
 		 1279 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0259  Outer membrane autotransporter barrel  32.63 
 
 		 940 aa  116  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  34.77 
 
 		 1055 aa  115  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  41.35 
 
 		 1019 aa  115  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.33 
 
 		 1795 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  38.16 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  39.39 
 
 		 1557 aa  112  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.85 
 
 		 1363 aa  112  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.99 
 
 		 1400 aa  111  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 		 759 aa  109  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  32.61 
 
 		 1628 aa  109  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.57 
 
 		 1884 aa  109  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.49 
 
 		 1156 aa  109  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.59 
 
 		 1544 aa  107  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.4 
 
 		 4800 aa  107  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 		 965 aa  107  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.43 
 
 		 595 aa  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.16 
 
 		 1164 aa  106  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.81 
 
 		 1183 aa  105  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  32.45 
 
 		 2836 aa  105  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.47 
 
 		 2689 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 		 9867 aa  103  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.43 
 
 		 437 aa  103  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.14 
 
 		 437 aa  99.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.85 
 
 		 1895 aa  99  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  27.04 
 
 		 3598 aa  98.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1027 aa  97.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 		 677 aa  98.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  31.04 
 
 		 1991 aa  97.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.32 
 
 		 546 aa  96.3  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>