More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51240 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  80.6 
 
 		 874 aa  744    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  100 
 
 		 1168 aa  2266    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  50.39 
 
 		 998 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  50.54 
 
 		 998 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  49.31 
 
 		 1839 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  51.15 
 
 		 889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  55.44 
 
 		 1403 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  53.12 
 
 		 858 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  52.98 
 
 		 901 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  50.41 
 
 		 856 aa  412  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.32 
 
 		 1610 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 		 1610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  44.42 
 
 		 515 aa  307  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.29 
 
 		 1180 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 		 495 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.18 
 
 		 2954 aa  195  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  62.58 
 
 		 553 aa  191  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30 
 
 		 855 aa  186  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  38.78 
 
 		 340 aa  184  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.06 
 
 		 1480 aa  174  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  28.36 
 
 		 1079 aa  166  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.94 
 
 		 3598 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  27.82 
 
 		 1156 aa  165  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  56.96 
 
 		 532 aa  164  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.87 
 
 		 1499 aa  157  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  27.4 
 
 		 1400 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  25.95 
 
 		 3954 aa  131  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  27.27 
 
 		 3026 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  22.58 
 
 		 2245 aa  121  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.04 
 
 		 2467 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 1925 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.73 
 
 		 1415 aa  108  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25.79 
 
 		 4798 aa  105  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.27 
 
 		 3209 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  26.81 
 
 		 1855 aa  102  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 2107 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  27.07 
 
 		 4334 aa  100  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  30.57 
 
 		 1164 aa  96.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  29.29 
 
 		 932 aa  96.3  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.78 
 
 		 946 aa  95.5  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  28.84 
 
 		 942 aa  95.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.19 
 
 		 556 aa  91.3  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  27.39 
 
 		 928 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.31 
 
 		 2836 aa  89.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.98 
 
 		 2911 aa  89.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  32.52 
 
 		 503 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.78 
 
 		 5769 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  35.93 
 
 		 214 aa  86.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.56 
 
 		 2678 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  31.52 
 
 		 1883 aa  84.7  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  25.77 
 
 		 4800 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  27.39 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  33.33 
 
 		 999 aa  82.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.11 
 
 		 2133 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 		 621 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 		 621 aa  82  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.23 
 
 		 820 aa  82  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  30.41 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 1789 aa  81.3  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.44 
 
 		 1019 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  26.8 
 
 		 1279 aa  81.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.41 
 
 		 745 aa  80.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.2 
 
 		 1197 aa  79.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  33.21 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  25.54 
 
 		 1764 aa  78.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  33.21 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.1 
 
 		 2667 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.63 
 
 		 2198 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  27.54 
 
 		 965 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  25.24 
 
 		 1134 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  26.7 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.89 
 
 		 2807 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  31.46 
 
 		 1055 aa  75.5  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  27.89 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.43 
 
 		 1534 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.13 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  28.8 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 475 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.58 
 
 		 3619 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  32.18 
 
 		 475 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.05 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.05 
 
 		 1029 aa  72.8  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27 
 
 		 2775 aa  72.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  33.21 
 
 		 437 aa  72  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.07 
 
 		 1582 aa  71.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  27.87 
 
 		 824 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  25.34 
 
 		 851 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 		 1532 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  28.35 
 
 		 2097 aa  70.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1306 aa  69.7  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  29.95 
 
 		 3619 aa  70.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  26.53 
 
 		 1884 aa  69.3  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  46.67 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  50.56 
 
 		 4836 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  31.67 
 
 		 2567 aa  68.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  30.47 
 
 		 727 aa  67.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 		 467 aa  67.4  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  28.46 
 
 		 571 aa  67  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>