More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0833 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 571 aa  1130    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  28.14 
 
 		 1043 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.58 
 
 		 1079 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.92 
 
 		 2667 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  28.65 
 
 		 767 aa  98.2  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.44 
 
 		 946 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 4334 aa  93.6  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.46 
 
 		 595 aa  93.6  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  28.57 
 
 		 942 aa  91.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.79 
 
 		 3954 aa  90.5  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.3 
 
 		 1279 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.8 
 
 		 1499 aa  88.6  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  26.06 
 
 		 1534 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.3 
 
 		 980 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  27.1 
 
 		 1532 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.16 
 
 		 1156 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.18 
 
 		 4798 aa  83.6  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  29.23 
 
 		 3619 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.53 
 
 		 2775 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  29.04 
 
 		 3619 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 1400 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.83 
 
 		 2807 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  30.87 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.55 
 
 		 709 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.93 
 
 		 2954 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 		 1582 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.37 
 
 		 1363 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.45 
 
 		 1236 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.27 
 
 		 4687 aa  77.4  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.71 
 
 		 2689 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 		 1895 aa  77  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  32.84 
 
 		 387 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1424 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.81 
 
 		 1795 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.17 
 
 		 928 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  37.56 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  27.51 
 
 		 1164 aa  75.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  29.48 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.04 
 
 		 833 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  26.38 
 
 		 1864 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.55 
 
 		 2668 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  30.45 
 
 		 959 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.45 
 
 		 526 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.19 
 
 		 1839 aa  73.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.68 
 
 		 998 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  27.56 
 
 		 1480 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 2198 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  28.43 
 
 		 932 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  31.35 
 
 		 460 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.32 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  34.78 
 
 		 2950 aa  72  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  32.5 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.8 
 
 		 813 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  25.88 
 
 		 3209 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.73 
 
 		 2105 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  30.77 
 
 		 998 aa  70.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.13 
 
 		 824 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.47 
 
 		 2467 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.05 
 
 		 2133 aa  70.1  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.16 
 
 		 860 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.43 
 
 		 965 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  29.25 
 
 		 1712 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  29.79 
 
 		 865 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 2107 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.46 
 
 		 855 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.85 
 
 		 1145 aa  69.3  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  29.2 
 
 		 3608 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.1 
 
 		 3427 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.45 
 
 		 1180 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  27.71 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  28.28 
 
 		 850 aa  68.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  30.92 
 
 		 950 aa  68.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.13 
 
 		 2097 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.46 
 
 		 1403 aa  68.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  28.84 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.53 
 
 		 2911 aa  68.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  34.08 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 		 1287 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.84 
 
 		 1883 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.47 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.07 
 
 		 2145 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.1 
 
 		 999 aa  67.4  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  24.11 
 
 		 2245 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  29.64 
 
 		 1884 aa  67.4  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  28.1 
 
 		 856 aa  67.4  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 		 2836 aa  67  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  28.46 
 
 		 1168 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.97 
 
 		 4800 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  28.85 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  30.96 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1306 aa  65.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  31.2 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.2 
 
 		 1963 aa  65.1  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.34 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>