241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1886 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 495 aa  963    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  42.13 
 
 		 998 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.95 
 
 		 1839 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  39.09 
 
 		 889 aa  240  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  37.32 
 
 		 515 aa  239  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.8 
 
 		 998 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.89 
 
 		 1403 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  37.96 
 
 		 856 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  37.21 
 
 		 858 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  38.2 
 
 		 1168 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  36.44 
 
 		 901 aa  216  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.17 
 
 		 874 aa  207  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  40.06 
 
 		 1610 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  40.07 
 
 		 1610 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  37.66 
 
 		 340 aa  154  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.55 
 
 		 553 aa  94  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  40.14 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  33.47 
 
 		 855 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  38.89 
 
 		 214 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.64 
 
 		 1480 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.89 
 
 		 1499 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.19 
 
 		 2954 aa  67  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.63 
 
 		 1400 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  28.27 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  33.49 
 
 		 1156 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.33 
 
 		 2245 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.33 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 4334 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 1079 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  30.74 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  30.74 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  43.64 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  36.14 
 
 		 4687 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.51 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.8 
 
 		 3427 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.21 
 
 		 1883 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.61 
 
 		 1180 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 1884 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.09 
 
 		 518 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.08 
 
 		 1055 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  28.92 
 
 		 1814 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  30.36 
 
 		 2701 aa  55.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 		 4800 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.77 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  44.44 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.22 
 
 		 946 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.51 
 
 		 2678 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.34 
 
 		 1197 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  43.66 
 
 		 2467 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  40.59 
 
 		 760 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.03 
 
 		 3954 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 652 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  39.05 
 
 		 709 aa  53.9  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  26.07 
 
 		 648 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.22 
 
 		 3598 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.38 
 
 		 1372 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 1073 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  31.7 
 
 		 833 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  45.54 
 
 		 3209 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.64 
 
 		 1164 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.9 
 
 		 3026 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.81 
 
 		 485 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  27.96 
 
 		 2133 aa  52  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 		 759 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  36.23 
 
 		 313 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.03 
 
 		 999 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.36 
 
 		 2911 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  26.02 
 
 		 1895 aa  51.2  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.05 
 
 		 833 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  26.32 
 
 		 535 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  27.83 
 
 		 556 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.34 
 
 		 677 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  36.23 
 
 		 313 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  42.17 
 
 		 1544 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.64 
 
 		 2775 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  57.69 
 
 		 280 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.9 
 
 		 5769 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.33 
 
 		 1795 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 1607 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  33.61 
 
 		 475 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  58.33 
 
 		 2105 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  57.69 
 
 		 2667 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  57.69 
 
 		 280 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  57.69 
 
 		 4122 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.63 
 
 		 4798 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  40.2 
 
 		 833 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.05 
 
 		 745 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.79 
 
 		 813 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  56.6 
 
 		 1390 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  28.09 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  42.11 
 
 		 1434 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.9 
 
 		 1236 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  34.51 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  50.91 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.88 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  53.33 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.01 
 
 		 1925 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 621 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>