248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  88.52 
 
 		 214 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  45.08 
 
 		 1403 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.73 
 
 		 1839 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 515 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  41.06 
 
 		 998 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  43.14 
 
 		 856 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  41.53 
 
 		 1610 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  42.72 
 
 		 998 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  44.09 
 
 		 901 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  38.78 
 
 		 1168 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  43.23 
 
 		 889 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  43.38 
 
 		 858 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  38.1 
 
 		 1610 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  40.8 
 
 		 874 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  37.66 
 
 		 495 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  54.86 
 
 		 553 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  46.15 
 
 		 532 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.18 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  31.6 
 
 		 1133 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  30.66 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  30.66 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  47.42 
 
 		 2097 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  32.73 
 
 		 1055 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.48 
 
 		 1180 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 		 1079 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21271  hypothetical protein  38.14 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  36.03 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.26 
 
 		 3954 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.17 
 
 		 855 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.28 
 
 		 1480 aa  59.3  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.17 
 
 		 1156 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.11 
 
 		 1019 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.66 
 
 		 2542 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.36 
 
 		 1499 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.2 
 
 		 1883 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  32.55 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.58 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.94 
 
 		 4798 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.08 
 
 		 3026 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  55.13 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  45.45 
 
 		 448 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 		 946 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  30.68 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.29 
 
 		 5769 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.66 
 
 		 1287 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  29.9 
 
 		 516 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.62 
 
 		 2954 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  37.32 
 
 		 4678 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.31 
 
 		 4334 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  28.85 
 
 		 1197 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  28.43 
 
 		 999 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.39 
 
 		 3209 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.7 
 
 		 485 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  32.32 
 
 		 786 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  40.22 
 
 		 760 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.44 
 
 		 1855 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  32.19 
 
 		 437 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 		 547 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  45.26 
 
 		 8682 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  41.57 
 
 		 677 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  46.97 
 
 		 1502 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  35.71 
 
 		 5218 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27271  hypothetical protein  45.78 
 
 		 715 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.6 
 
 		 1534 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.48 
 
 		 2467 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 		 817 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.88 
 
 		 4800 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  32.43 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  43.33 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  41.41 
 
 		 982 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  38.02 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 		 2469 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 		 2704 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  28.73 
 
 		 5171 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  40.48 
 
 		 3587 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  31.68 
 
 		 1202 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  54.39 
 
 		 1394 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34 
 
 		 3619 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  35.77 
 
 		 2567 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 		 1582 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  38.14 
 
 		 219 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 467 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.36 
 
 		 759 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  39.05 
 
 		 3263 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.46 
 
 		 2689 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.73 
 
 		 3619 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  27.63 
 
 		 2245 aa  50.4  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.89 
 
 		 824 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.11 
 
 		 1279 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  32.63 
 
 		 682 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.59 
 
 		 833 aa  50.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 		 491 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  40.91 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  48.28 
 
 		 3314 aa  49.7  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.06 
 
 		 1363 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>