More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3523 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
462 aa  876    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  78.98 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  78.08 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  51.43 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.78 
 
 
1029 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  37.78 
 
 
1029 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.43 
 
 
1415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.95 
 
 
2954 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  39.14 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.2 
 
 
3608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.86 
 
 
395 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  40.51 
 
 
3209 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  45.53 
 
 
1764 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  45.93 
 
 
2807 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  38.53 
 
 
907 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 
2198 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  44.66 
 
 
2133 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
2467 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  45.1 
 
 
768 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.2 
 
 
3619 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 
3954 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.68 
 
 
1019 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.37 
 
 
4334 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
1855 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.98 
 
 
3619 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 
851 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.1 
 
 
824 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.78 
 
 
1197 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  43.23 
 
 
465 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.29 
 
 
1055 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  40.08 
 
 
727 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  46.83 
 
 
1133 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  44.39 
 
 
1534 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  42.29 
 
 
3026 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.65 
 
 
1532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  34.45 
 
 
467 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  37.19 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  43.14 
 
 
1610 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  38.36 
 
 
475 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.63 
 
 
820 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  39.36 
 
 
1134 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.14 
 
 
1180 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  39.15 
 
 
1557 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  34.98 
 
 
1839 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  35.03 
 
 
1582 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  42.08 
 
 
1610 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 
574 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 
2097 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  34.18 
 
 
546 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  40.48 
 
 
2950 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.46 
 
 
1145 aa  94  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  48.21 
 
 
614 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.28 
 
 
1037 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.84 
 
 
1079 aa  92.8  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  36.16 
 
 
946 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  35.11 
 
 
745 aa  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.61 
 
 
588 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  31.7 
 
 
998 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
2701 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  34.51 
 
 
1403 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.8 
 
 
998 aa  87  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  35.54 
 
 
1213 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.55 
 
 
2911 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
2105 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  32.56 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  33.69 
 
 
858 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  33.97 
 
 
648 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  34.77 
 
 
4687 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  34.75 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.7 
 
 
795 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 
2678 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.98 
 
 
980 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  30.41 
 
 
1168 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.25 
 
 
1072 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  33.75 
 
 
928 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  40.15 
 
 
540 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.47 
 
 
1795 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  28.17 
 
 
556 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  35.26 
 
 
1424 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  37.6 
 
 
2667 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 
2567 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.28 
 
 
2775 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.07 
 
 
3598 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.29 
 
 
1236 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.18 
 
 
759 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  46.3 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  42.76 
 
 
709 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  32.03 
 
 
942 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  32.3 
 
 
856 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  32.34 
 
 
982 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  46.3 
 
 
531 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.69 
 
 
1279 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.14 
 
 
1499 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  30.9 
 
 
901 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.18 
 
 
1164 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 
526 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.47 
 
 
2145 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>