More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51250 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  61.53 
 
 		 998 aa  917    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  52.08 
 
 		 1610 aa  636    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  61.34 
 
 		 1839 aa  942    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  100 
 
 		 856 aa  1665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  62.02 
 
 		 1403 aa  953    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  60.69 
 
 		 998 aa  901    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  55.09 
 
 		 874 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  61.96 
 
 		 553 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  50 
 
 		 1610 aa  618  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  59.96 
 
 		 532 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  52.87 
 
 		 889 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  52.71 
 
 		 901 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  53.78 
 
 		 858 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  50 
 
 		 1168 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 515 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1886  hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 		 495 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33540  hypothetical protein  43.14 
 
 		 340 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.386759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.13 
 
 		 1180 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.2 
 
 		 1480 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.29 
 
 		 2954 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1079 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.74 
 
 		 855 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.29 
 
 		 946 aa  108  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.85 
 
 		 3598 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.27 
 
 		 820 aa  105  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.77 
 
 		 3954 aa  102  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  30.8 
 
 		 1156 aa  99  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.35 
 
 		 1499 aa  98.6  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.72 
 
 		 5769 aa  97.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.77 
 
 		 2911 aa  97.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16670  serralysin-like metalloprotease family protiein  39.09 
 
 		 214 aa  96.3  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160077  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 313 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 		 4334 aa  94  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.76 
 
 		 1055 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.57 
 
 		 942 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  35.17 
 
 		 1164 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.79 
 
 		 1855 aa  89.7  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  30.11 
 
 		 503 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.35 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.05 
 
 		 2807 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  35.79 
 
 		 4687 aa  89  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.67 
 
 		 3209 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  30.06 
 
 		 503 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  35.11 
 
 		 329 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  35.11 
 
 		 329 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  32.04 
 
 		 1019 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  32.13 
 
 		 1424 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.81 
 
 		 4798 aa  86.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 2107 aa  85.5  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  33.98 
 
 		 1884 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.85 
 
 		 2467 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.63 
 
 		 1415 aa  85.1  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 		 4800 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 		 795 aa  84.7  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  28.27 
 
 		 2198 aa  84.7  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  33.73 
 
 		 1883 aa  84.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.85 
 
 		 999 aa  84.3  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  32.88 
 
 		 3619 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.75 
 
 		 1197 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.41 
 
 		 3619 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 1400 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  28.93 
 
 		 851 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.16 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  29.12 
 
 		 2133 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 		 1582 aa  81.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50.5 
 
 		 3427 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.11 
 
 		 1279 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.57 
 
 		 3608 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  32.63 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  29.98 
 
 		 932 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  35.06 
 
 		 313 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.33 
 
 		 2836 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 824 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.36 
 
 		 2667 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.43 
 
 		 2704 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.44 
 
 		 980 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  54.17 
 
 		 4678 aa  79.7  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  46.22 
 
 		 4106 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  50.47 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 982 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  47.42 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.05 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  40.25 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 		 759 aa  78.2  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  48.57 
 
 		 2743 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.87 
 
 		 3026 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  29.6 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.27 
 
 		 2689 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.43 
 
 		 1712 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.54 
 
 		 928 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.21 
 
 		 833 aa  77  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.07 
 
 		 2145 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  27.97 
 
 		 595 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  35.15 
 
 		 1534 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  41.48 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  35.98 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>