More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1997 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
786 aa  1502    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  91.69 
 
 
817 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  36.06 
 
 
767 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.19 
 
 
1197 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  55 
 
 
2251 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  39.9 
 
 
759 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52 
 
 
3314 aa  82.4  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  52.27 
 
 
2542 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.47 
 
 
5962 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  52.27 
 
 
8682 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  52.27 
 
 
9030 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  54.55 
 
 
5218 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  51.14 
 
 
4678 aa  79  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.99 
 
 
575 aa  78.2  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.86 
 
 
3427 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  38.69 
 
 
856 aa  77.8  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  59.42 
 
 
4106 aa  77.4  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  41.73 
 
 
1037 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  54.12 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  54.12 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.24 
 
 
5839 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
686 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  41.88 
 
 
2704 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  35.48 
 
 
2160 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  43.88 
 
 
7284 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  46.49 
 
 
504 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  43 
 
 
4687 aa  73.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  37.04 
 
 
385 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.95 
 
 
1800 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47 
 
 
2678 aa  72  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 
2097 aa  72  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  42.24 
 
 
4854 aa  71.6  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  45 
 
 
486 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.86 
 
 
6753 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.72 
 
 
556 aa  71.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  49.46 
 
 
3209 aa  70.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  59.42 
 
 
1883 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  49.02 
 
 
202 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  49.02 
 
 
202 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  53.25 
 
 
1424 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  45.92 
 
 
2105 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.92 
 
 
1795 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  45.65 
 
 
1166 aa  70.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
1287 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.04 
 
 
1061 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  45.79 
 
 
2042 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  45.54 
 
 
417 aa  70.1  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  41.51 
 
 
503 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  46.6 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.03 
 
 
1145 aa  70.1  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.54 
 
 
727 aa  69.3  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  43.88 
 
 
1346 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  50.65 
 
 
2667 aa  68.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  42.28 
 
 
1279 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  52.56 
 
 
3608 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  59.02 
 
 
7149 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  38.89 
 
 
2336 aa  68.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  52.78 
 
 
1055 aa  68.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  51.35 
 
 
4798 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 
917 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  48.62 
 
 
1895 aa  68.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  44.14 
 
 
5171 aa  68.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 
2296 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.1 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  44.44 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  55.7 
 
 
946 aa  67.8  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.19 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  51.28 
 
 
1164 aa  67.4  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  52.56 
 
 
1534 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  45 
 
 
313 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  47.67 
 
 
2452 aa  67  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  41.94 
 
 
874 aa  67.4  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.83 
 
 
593 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  55.84 
 
 
421 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  38 
 
 
329 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  38 
 
 
329 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  44.44 
 
 
606 aa  66.6  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  49.37 
 
 
2689 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  47.5 
 
 
3598 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  55.84 
 
 
260 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  57.97 
 
 
1079 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 
6779 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  50 
 
 
1499 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  50.67 
 
 
467 aa  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.96 
 
 
4220 aa  65.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  48.96 
 
 
1699 aa  65.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  46.99 
 
 
503 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  45.12 
 
 
424 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 
6683 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  42.45 
 
 
327 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 
6662 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  48.53 
 
 
717 aa  65.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  44.34 
 
 
243 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.54 
 
 
2346 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.97 
 
 
2239 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  49.4 
 
 
3619 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  46 
 
 
561 aa  65.1  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  47.73 
 
 
709 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06181  hypothetical protein  38.94 
 
 
277 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0381499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
375 aa  65.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>