More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05070 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  41.82 
 
 		 3516 aa  1647    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  100 
 
 		 4106 aa  7345    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  42.11 
 
 		 3739 aa  1650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  29.23 
 
 		 5559 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  29.65 
 
 		 5561 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  40.34 
 
 		 3325 aa  1396    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.18 
 
 		 7149 aa  719    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  29.84 
 
 		 5080 aa  901    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.36 
 
 		 6683 aa  714    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  43.67 
 
 		 3562 aa  1729    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  34.42 
 
 		 6779 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  29.36 
 
 		 5561 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  34.41 
 
 		 6662 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  34.94 
 
 		 3204 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.64 
 
 		 3552 aa  1518    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  41.95 
 
 		 3824 aa  1607    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  41.76 
 
 		 3721 aa  1615    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  56.72 
 
 		 2704 aa  2185    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  38.86 
 
 		 4480 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  41.7 
 
 		 3824 aa  1595    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  41.66 
 
 		 3824 aa  1587    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  29.14 
 
 		 5559 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  38.98 
 
 		 2456 aa  951    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.28 
 
 		 5561 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  37.92 
 
 		 2625 aa  974    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  32.96 
 
 		 4430 aa  1087    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  32.53 
 
 		 3314 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  35.03 
 
 		 2911 aa  553  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  30.13 
 
 		 4689 aa  553  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  40.19 
 
 		 2927 aa  545  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  30.18 
 
 		 6310 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  29.96 
 
 		 8064 aa  463  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  29.93 
 
 		 5451 aa  427  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  34.77 
 
 		 6715 aa  423  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  30.08 
 
 		 3923 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  31.87 
 
 		 5442 aa  381  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 4678 aa  371  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  28.56 
 
 		 4874 aa  360  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  47.51 
 
 		 1278 aa  294  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  28.06 
 
 		 3736 aa  242  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.89 
 
 		 5839 aa  242  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  27.67 
 
 		 3734 aa  226  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  29.41 
 
 		 5745 aa  220  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  30.21 
 
 		 1461 aa  206  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.07 
 
 		 2839 aa  172  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1029  hemolysin-type calcium-binding region  46.18 
 
 		 1529 aa  163  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297534 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  46.88 
 
 		 1598 aa  159  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3150  hypothetical protein  38.42 
 
 		 959 aa  156  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.9 
 
 		 5216 aa  155  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  28.54 
 
 		 3586 aa  153  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1696  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46.08 
 
 		 1586 aa  151  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.92 
 
 		 2402 aa  149  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.68 
 
 		 16322 aa  137  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.25 
 
 		 3793 aa  132  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  41.7 
 
 		 635 aa  129  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  28 
 
 		 4285 aa  127  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  27.17 
 
 		 4661 aa  123  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  41.62 
 
 		 1166 aa  121  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  25.14 
 
 		 4978 aa  111  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  44.22 
 
 		 4854 aa  110  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1699 aa  110  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  24.31 
 
 		 3927 aa  110  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  35.74 
 
 		 1152 aa  108  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  38.08 
 
 		 739 aa  106  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  26.8 
 
 		 5094 aa  105  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  43.26 
 
 		 2452 aa  105  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  24.7 
 
 		 2552 aa  103  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.97 
 
 		 1219 aa  102  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  33.94 
 
 		 2768 aa  100  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.92 
 
 		 5218 aa  100  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  42.7 
 
 		 1883 aa  99.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  48.48 
 
 		 1538 aa  99.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.59 
 
 		 2656 aa  99.4  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.46 
 
 		 2542 aa  99  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  38.71 
 
 		 1346 aa  97.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  42.25 
 
 		 8682 aa  97.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.81 
 
 		 3477 aa  97.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  29.47 
 
 		 1096 aa  97.1  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.3 
 
 		 4836 aa  97.4  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  34.62 
 
 		 4672 aa  97.1  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.61 
 
 		 5962 aa  95.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  41.55 
 
 		 9030 aa  95.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.09 
 
 		 1092 aa  95.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  38 
 
 		 4220 aa  95.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.45 
 
 		 3391 aa  95.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  40.85 
 
 		 6753 aa  94.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.33 
 
 		 1553 aa  94.4  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  48.74 
 
 		 2251 aa  94  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  29.66 
 
 		 500 aa  94  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3383  conserved repeat domain protein  30.04 
 
 		 888 aa  93.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  40.8 
 
 		 3209 aa  93.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  56 
 
 		 1424 aa  92.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  49.59 
 
 		 467 aa  92.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.96 
 
 		 588 aa  92  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  40.98 
 
 		 747 aa  91.3  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  28.35 
 
 		 5743 aa  90.9  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.5 
 
 		 1016 aa  90.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.98 
 
 		 485 aa  89.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  44.7 
 
 		 2296 aa  89.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  55.79 
 
 		 202 aa  89.4  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>