102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0994 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1601  hypothetical protein  32.49 
 
 		 6715 aa  932    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  34.79 
 
 		 1461 aa  682    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 4874 aa  9355    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  31.89 
 
 		 4678 aa  810    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.65 
 
 		 5839 aa  603  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.6 
 
 		 4689 aa  599  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  28.55 
 
 		 5444 aa  570  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  27.06 
 
 		 6779 aa  530  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.39 
 
 		 6683 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  27.35 
 
 		 6662 aa  518  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.1 
 
 		 5561 aa  348  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.14 
 
 		 5559 aa  347  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.02 
 
 		 5559 aa  343  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.02 
 
 		 5561 aa  342  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  24.97 
 
 		 5561 aa  337  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1001  C-type lectin domain-containing protein  28 
 
 		 3325 aa  312  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.18 
 
 		 3739 aa  261  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  29.41 
 
 		 4214 aa  247  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.9 
 
 		 3314 aa  246  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.47 
 
 		 3721 aa  240  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  27.55 
 
 		 4106 aa  235  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  27.31 
 
 		 3824 aa  230  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  27.97 
 
 		 3562 aa  227  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.27 
 
 		 3824 aa  226  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  27.2 
 
 		 3824 aa  226  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  25.99 
 
 		 7149 aa  160  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  28.34 
 
 		 2704 aa  159  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3119  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 		 3552 aa  152  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0912825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  27.06 
 
 		 4791 aa  151  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  28.95 
 
 		 3333 aa  145  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  28.64 
 
 		 5442 aa  139  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0531  hypothetical protein  30.76 
 
 		 850 aa  136  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.744468  normal  0.643161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33430  Ig-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 3230 aa  125  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  27.52 
 
 		 2456 aa  119  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.61 
 
 		 2625 aa  119  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.61 
 
 		 6310 aa  111  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  31.41 
 
 		 739 aa  107  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.89 
 
 		 2812 aa  106  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  29.92 
 
 		 2927 aa  102  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  28.39 
 
 		 2839 aa  102  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1051  hypothetical protein  24.15 
 
 		 4430 aa  99  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  26.15 
 
 		 2768 aa  91.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.36 
 
 		 3204 aa  91.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  26.53 
 
 		 8064 aa  91.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  30.58 
 
 		 606 aa  86.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  26.01 
 
 		 3586 aa  79.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0899  large repetitive protein  25.11 
 
 		 5080 aa  78.2  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.14 
 
 		 2911 aa  76.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  25.65 
 
 		 898 aa  76.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  28.24 
 
 		 1951 aa  72  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  24.84 
 
 		 5743 aa  72  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0845  hypothetical protein  30.4 
 
 		 5451 aa  67.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2918  hypothetical protein  34.51 
 
 		 714 aa  67.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  29.97 
 
 		 1092 aa  66.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 		 5171 aa  66.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.19 
 
 		 2528 aa  65.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  31.2 
 
 		 3923 aa  65.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.34 
 
 		 5216 aa  63.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.19 
 
 		 913 aa  62.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1278 aa  62.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.24 
 
 		 899 aa  61.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  28.53 
 
 		 916 aa  60.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.05 
 
 		 1570 aa  60.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  33.85 
 
 		 1621 aa  60.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.21 
 
 		 1570 aa  59.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  22.63 
 
 		 1695 aa  59.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  24.97 
 
 		 3470 aa  58.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0553  hypothetical protein  27.62 
 
 		 500 aa  58.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  25.92 
 
 		 888 aa  57.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1804 aa  57.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1061 aa  57.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3186  hypothetical protein  28.46 
 
 		 686 aa  57.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.958753  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.52 
 
 		 2239 aa  57.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  31.07 
 
 		 3758 aa  55.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  38.52 
 
 		 2807 aa  55.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  26.52 
 
 		 549 aa  55.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  26.6 
 
 		 1428 aa  55.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  24.89 
 
 		 2743 aa  54.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  22.52 
 
 		 2552 aa  53.9  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  28.98 
 
 		 777 aa  53.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.19 
 
 		 1332 aa  53.5  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  28.22 
 
 		 937 aa  52.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  25.32 
 
 		 1219 aa  51.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  27.46 
 
 		 3925 aa  50.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1585 aa  50.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  29.45 
 
 		 635 aa  50.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 3954 aa  50.4  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  35.92 
 
 		 4480 aa  49.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1902 aa  50.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  24.66 
 
 		 3516 aa  50.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  29.61 
 
 		 1301 aa  49.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  25.06 
 
 		 4285 aa  49.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.05 
 
 		 1919 aa  49.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.52 
 
 		 5098 aa  49.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  26.22 
 
 		 3734 aa  49.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  36.57 
 
 		 4748 aa  49.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1551  hypothetical protein  24.73 
 
 		 872 aa  49.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  27.57 
 
 		 711 aa  48.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  26.91 
 
 		 1196 aa  48.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.19 
 
 		 8918 aa  47.8  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>