20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1551 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1551  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1550  hypothetical protein  34.81 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.578829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  25 
 
 		 3562 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  27.84 
 
 		 2625 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  42.17 
 
 		 3925 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  27.35 
 
 		 3824 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 917 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  24.73 
 
 		 4874 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  29.44 
 
 		 3923 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  27.35 
 
 		 3739 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  27.35 
 
 		 3721 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  26.94 
 
 		 3824 aa  48.9  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0830  glycoprotein  28.37 
 
 		 8064 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  28.02 
 
 		 1951 aa  48.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  28.79 
 
 		 2193 aa  47.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  26.94 
 
 		 3824 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  28.17 
 
 		 2042 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  29.87 
 
 		 2456 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0806  surface adhesion protein, putative  26.44 
 
 		 6310 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  25.62 
 
 		 1096 aa  44.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>