73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0767 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  100 
 
 		 1804 aa  3532    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  63.95 
 
 		 2042 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  36.18 
 
 		 2192 aa  266  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  40.92 
 
 		 1902 aa  245  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  50.38 
 
 		 777 aa  243  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  49.81 
 
 		 1951 aa  231  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  44.64 
 
 		 2528 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  49.24 
 
 		 916 aa  214  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  45.39 
 
 		 549 aa  195  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1585 aa  168  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1588 aa  159  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  34.67 
 
 		 913 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  33.62 
 
 		 898 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  37.77 
 
 		 937 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.59 
 
 		 888 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  30.39 
 
 		 906 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.84 
 
 		 899 aa  123  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  44.87 
 
 		 2636 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  35.23 
 
 		 694 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  77.14 
 
 		 1241 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  33.03 
 
 		 696 aa  110  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  30.09 
 
 		 888 aa  108  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  31.74 
 
 		 3586 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  35.27 
 
 		 1779 aa  85.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  36.7 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.08 
 
 		 1047 aa  85.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.39 
 
 		 2117 aa  77.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  30.32 
 
 		 3925 aa  76.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  27.27 
 
 		 2350 aa  76.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1439 aa  74.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  43.42 
 
 		 983 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  29.06 
 
 		 6109 aa  71.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  26.72 
 
 		 1332 aa  70.1  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1428  hypothetical protein  49 
 
 		 794 aa  70.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  38 
 
 		 2042 aa  70.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  64.1 
 
 		 2802 aa  70.1  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  40.6 
 
 		 1869 aa  69.3  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0581  PKD domain protein  28.17 
 
 		 1461 aa  63.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.3 
 
 		 1550 aa  60.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0437  hypothetical protein  26.89 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.516029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  23.94 
 
 		 1570 aa  59.3  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  22.73 
 
 		 1570 aa  59.3  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.01 
 
 		 1224 aa  57.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1660  hypothetical protein  31.93 
 
 		 336 aa  57.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0994  hypothetical protein  25.86 
 
 		 4874 aa  57.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.5 
 
 		 5216 aa  57.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0969  hypothetical protein  39.6 
 
 		 340 aa  57.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  30.86 
 
 		 1532 aa  56.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0150  hypothetical protein  25.6 
 
 		 831 aa  56.2  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  30.1 
 
 		 2552 aa  56.2  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  26.15 
 
 		 1621 aa  55.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0600  hypothetical protein  34.88 
 
 		 531 aa  53.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0882  hypothetical protein  24.1 
 
 		 282 aa  54.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4062  hypothetical protein  27.83 
 
 		 711 aa  53.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  41.56 
 
 		 780 aa  52.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  27.14 
 
 		 5743 aa  52  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  28.26 
 
 		 1369 aa  51.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01400  RTX toxin, putative  28.48 
 
 		 606 aa  50.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  38.16 
 
 		 1147 aa  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  26.05 
 
 		 895 aa  48.9  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  28.31 
 
 		 574 aa  48.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2987  Fibronectin type III domain protein  42.55 
 
 		 1301 aa  47.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0839301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  29.09 
 
 		 739 aa  47.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  25 
 
 		 2004 aa  46.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4606  large repetitive protein  25.3 
 
 		 5559 aa  46.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0244  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  46.2  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4656  hypothetical protein  25.3 
 
 		 5559 aa  46.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4512  large repetitive protein  25.3 
 
 		 5561 aa  45.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  25.3 
 
 		 5561 aa  45.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  25.45 
 
 		 739 aa  45.8  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  25.3 
 
 		 5561 aa  45.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  26.12 
 
 		 768 aa  45.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.05 
 
 		 1096 aa  45.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>