28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2793 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1172    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3553  hypothetical protein  35.75 
 
 		 595 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0357748  normal  0.360509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.4 
 
 		 2000 aa  143  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2786  hypothetical protein  32.42 
 
 		 309 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000495894  hitchhiker  0.000401218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  47.22 
 
 		 898 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  38.38 
 
 		 1311 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.66 
 
 		 2122 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  37.08 
 
 		 3925 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  32.5 
 
 		 899 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  35.42 
 
 		 976 aa  54.3  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  35.19 
 
 		 1328 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  36 
 
 		 913 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  37.78 
 
 		 3586 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  35.9 
 
 		 961 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.58 
 
 		 6885 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  29.63 
 
 		 1951 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0767  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1804 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  28.1 
 
 		 1621 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6710  NHL repeat containing protein  37.35 
 
 		 692 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.75 
 
 		 1919 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  37.21 
 
 		 916 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  27.66 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  43.21 
 
 		 888 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  24.69 
 
 		 551 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  32.88 
 
 		 777 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.53 
 
 		 953 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1588 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.33 
 
 		 2042 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>