27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2795 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  100 
 
 
961 aa  1919    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  50.74 
 
 
1120 aa  623  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  88.32 
 
 
551 aa  537  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3552  hypothetical protein  45.25 
 
 
411 aa  257  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00554612  normal  0.225242 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.22 
 
 
2122 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3554  cell surface glycoprotein  37.46 
 
 
328 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00624743  normal  0.690618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.89 
 
 
2000 aa  102  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  42.61 
 
 
1328 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  41.01 
 
 
1311 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2784  cell surface glycoprotein  29.6 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00261354  hitchhiker  0.000481239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  34.58 
 
 
564 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  37.89 
 
 
486 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  51.79 
 
 
765 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  28.57 
 
 
497 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  29.41 
 
 
1023 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  32.31 
 
 
976 aa  56.6  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  36.26 
 
 
450 aa  55.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3553  hypothetical protein  29.47 
 
 
595 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0357748  normal  0.360509 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2793  hypothetical protein  35.9 
 
 
574 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.430464  hitchhiker  0.000384805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  38.64 
 
 
437 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  27.16 
 
 
551 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1521  hypothetical protein  43.1 
 
 
297 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0841425  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  42.17 
 
 
533 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  38.64 
 
 
462 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 
1245 aa  48.9  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  39.77 
 
 
2622 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3869  hypothetical protein  34.67 
 
 
325 aa  45.8  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>