19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8091 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  903    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  30.7 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  37.5 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  46.34 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8093  hypothetical protein  33.16 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  29.05 
 
 		 971 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  36.26 
 
 		 961 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9158  hypothetical protein  27.67 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.864653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2159  hypothetical protein  29.06 
 
 		 607 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  34.23 
 
 		 2622 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.62 
 
 		 810 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3674  hypothetical protein  29.82 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  43.64 
 
 		 765 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  42.59 
 
 		 4607 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6181  peptidase domain protein  51.11 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.729562  normal  0.0122483 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 		 618 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  25.53 
 
 		 497 aa  43.1  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  34.15 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>