40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2113 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  100 
 
 		 462 aa  873    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  68.79 
 
 		 486 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  93.72 
 
 		 437 aa  782    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  28.32 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.16 
 
 		 810 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.96 
 
 		 618 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  37.5 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  36.36 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  27.67 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  37.86 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  27.23 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  36.79 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1811  IcmE protein  16.73 
 
 		 1034 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0371  IcmE  16.73 
 
 		 1039 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1404  hypothetical protein  21.08 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000355362  hitchhiker  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  35.88 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  37.86 
 
 		 287 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  35.29 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  27.54 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  24.59 
 
 		 263 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  23.62 
 
 		 2196 aa  53.9  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5021  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  26.67 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5402  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  26.67 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.165043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5109  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  26.67 
 
 		 306 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5651  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  21.77 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.13 
 
 		 14916 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  30.07 
 
 		 380 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  32.17 
 
 		 2622 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  38.64 
 
 		 961 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  47.27 
 
 		 765 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  38.38 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0517  hypothetical protein  16.19 
 
 		 1048 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0493  hypothetical protein  16.19 
 
 		 1048 aa  47.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  23.26 
 
 		 449 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  20.42 
 
 		 1191 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  32.46 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  25.83 
 
 		 900 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  27.88 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  24.24 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  26.56 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>