16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3864 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  958    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  49.89 
 
 
485 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  42.04 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  40.09 
 
 
429 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  38.84 
 
 
429 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  34.7 
 
 
286 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  35.78 
 
 
618 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.07 
 
 
810 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  30.07 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  30.61 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  35.29 
 
 
462 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  33.94 
 
 
437 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  33.33 
 
 
287 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  36.23 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  35.78 
 
 
486 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  30.87 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>