16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5563 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  51.61 
 
 
477 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  41.04 
 
 
473 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  41.56 
 
 
429 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  37.73 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  30.8 
 
 
286 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  31.84 
 
 
618 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  29.71 
 
 
418 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  31.53 
 
 
810 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  34.34 
 
 
437 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  36.79 
 
 
462 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  36.79 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  33.6 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  37.74 
 
 
486 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  29.17 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  34.03 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>