28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1817 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  932    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  68.79 
 
 
462 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  65.5 
 
 
437 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.08 
 
 
810 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  38.24 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  32.99 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  46.34 
 
 
450 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  38.83 
 
 
473 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  38.93 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  30.18 
 
 
286 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  37.74 
 
 
485 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  36.75 
 
 
429 aa  64.3  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  33.54 
 
 
287 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  23.42 
 
 
349 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  37.89 
 
 
961 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.92 
 
 
739 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  35.78 
 
 
477 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0093  hypothetical protein  27.16 
 
 
179 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0132  hypothetical protein  40 
 
 
94 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000321747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  50 
 
 
765 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  30.94 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  29.66 
 
 
941 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.72 
 
 
831 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  29.49 
 
 
380 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  34.65 
 
 
1013 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  28.74 
 
 
483 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>