283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2958 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
739 aa  1553    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
739 aa  1553    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
739 aa  1553    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0710  hypothetical protein  23.49 
 
 
738 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2083  hypothetical protein  23.49 
 
 
738 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0798  hypothetical protein  23.88 
 
 
738 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2008  hypothetical protein  23.49 
 
 
738 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0739  hypothetical protein  23.49 
 
 
738 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1034  hypothetical protein  23.49 
 
 
738 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1892  hypothetical protein  23.66 
 
 
716 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 
825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 
825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 
825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  22.97 
 
 
825 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 
825 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  22.85 
 
 
825 aa  184  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  22.85 
 
 
862 aa  183  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  22.6 
 
 
844 aa  148  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0447  hypothetical protein  22.3 
 
 
543 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  22.42 
 
 
846 aa  139  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  21.33 
 
 
881 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.5 
 
 
866 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  22.71 
 
 
877 aa  95.1  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  25.21 
 
 
872 aa  94.7  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  22.91 
 
 
886 aa  94  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
880 aa  92  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
880 aa  92  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  22.4 
 
 
880 aa  92  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  22.12 
 
 
872 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  19.66 
 
 
381 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  24.09 
 
 
949 aa  78.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  22.62 
 
 
976 aa  78.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 
870 aa  78.2  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  22.92 
 
 
343 aa  77  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  20.97 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  18.21 
 
 
340 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  24.13 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.31 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  21.56 
 
 
576 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  19.27 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  21.31 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  21.31 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  21.31 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  29.01 
 
 
197 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  18.8 
 
 
309 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  20.96 
 
 
360 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1891  pentapeptide repeat-containing protein  22.45 
 
 
356 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 
567 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  20.96 
 
 
360 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  22.26 
 
 
370 aa  64.7  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  21.03 
 
 
360 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 
190 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 
367 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  22.22 
 
 
367 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  19.3 
 
 
355 aa  63.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  22.13 
 
 
452 aa  63.9  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  24.81 
 
 
710 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  19.56 
 
 
862 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  20.43 
 
 
734 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  20.36 
 
 
354 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  25.55 
 
 
230 aa  61.6  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 
213 aa  61.6  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  22.85 
 
 
706 aa  61.2  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3729  hypothetical protein  23.33 
 
 
200 aa  61.2  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.626497  normal  0.855124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 
200 aa  61.2  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  23.57 
 
 
420 aa  61.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  20.36 
 
 
354 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  24.22 
 
 
215 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  17.85 
 
 
412 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0448  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513486  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2084  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  22.73 
 
 
515 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0711  hypothetical protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2007  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0799  hypothetical protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  20.13 
 
 
311 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  18.07 
 
 
446 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0738  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1033  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  18.77 
 
 
401 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 
389 aa  58.9  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  23.65 
 
 
356 aa  59.3  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  18.77 
 
 
401 aa  58.9  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  17.23 
 
 
319 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  20.47 
 
 
521 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  21.83 
 
 
356 aa  57.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  23.31 
 
 
190 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  23.53 
 
 
191 aa  57.8  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  22.92 
 
 
486 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  21.4 
 
 
452 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  20.19 
 
 
354 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  20.19 
 
 
354 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 
193 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
193 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  20.19 
 
 
354 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  20.19 
 
 
354 aa  57.4  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>