16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2682 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  867    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  41.56 
 
 
485 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  39.86 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  40.33 
 
 
429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  37.89 
 
 
473 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  37.69 
 
 
286 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  30.72 
 
 
618 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  27.67 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  27.67 
 
 
462 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.96 
 
 
810 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  31.37 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  25.16 
 
 
418 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  36.75 
 
 
486 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  31.33 
 
 
483 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  27.33 
 
 
380 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>