17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6387 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6387  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  951    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3864  hypothetical protein  41.83 
 
 
477 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.571243  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5563  hypothetical protein  40.83 
 
 
485 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6425  hypothetical protein  39.25 
 
 
429 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2682  hypothetical protein  36.26 
 
 
429 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180189  normal  0.57701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0103  hypothetical protein  32.62 
 
 
286 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  33.94 
 
 
618 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.41 
 
 
810 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5793  hypothetical protein  25.48 
 
 
418 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  28.92 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  37.86 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  37.86 
 
 
437 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5600  hypothetical protein  32.5 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.88475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1817  hypothetical protein  38.83 
 
 
486 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2644  hypothetical protein  25.99 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  0.961542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  28.27 
 
 
483 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.9 
 
 
941 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>