21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1404 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1404  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000355362  hitchhiker  0.00105308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2113  Repeat of unknown function XGLTT  21.08 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2043  XGLTT repeat protein  22.93 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  23.53 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  22.67 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0696  putative copper-resistance protein CopB  24.07 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000706782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  21.85 
 
 		 260 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  20.31 
 
 		 1115 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1090  hypothetical protein  37.35 
 
 		 227 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  18.14 
 
 		 1191 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  15.1 
 
 		 788 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  15.1 
 
 		 788 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  15.1 
 
 		 788 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  19.53 
 
 		 213 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27250  hypothetical protein  35 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354671  normal  0.303953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  16.79 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  22.11 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  21.21 
 
 		 3521 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.32 
 
 		 14916 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  25.22 
 
 		 1057 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  20.34 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>