More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0019 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  53.37 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  51.33 
 
 		 332 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  50.83 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  47.86 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  53 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  55.1 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  52.99 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.96 
 
 		 525 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  46.55 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  39.1 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  44.55 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.43 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.51 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  51.92 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.67 
 
 		 745 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  47.86 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  51.55 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  49.04 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 567 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.66 
 
 		 449 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  44.44 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  43.85 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  59.49 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.79 
 
 		 1033 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.32 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  59.49 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  47.75 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  49.53 
 
 		 776 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.65 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  45.13 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.22 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  46.3 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  45.54 
 
 		 533 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  41.96 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  47.47 
 
 		 973 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  44.27 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.79 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  53.27 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  34.3 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  37.01 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  37.01 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  47.62 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.22 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.39 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  44.25 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  54 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4923  Serine/threonine protein kinase  41.07 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  38.06 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  56.96 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  41.79 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  43.22 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.87 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  39.73 
 
 		 441 aa  72.8  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  41.79 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  35.75 
 
 		 450 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 		 412 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 		 182 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 401 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  41.48 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  48.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.03 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  38.28 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  45.19 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 		 903 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  46.36 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  54.43 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.98 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  50.51 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  54.43 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  42.37 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  49.48 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  43.44 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  45.3 
 
 		 870 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  42.02 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  48.84 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  45.61 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  47.87 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  46.53 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  38.52 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.33 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.1 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  42.96 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  39.26 
 
 		 438 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  49.4 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  39.06 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  35.37 
 
 		 419 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>