More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1211 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
419 aa  832    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  50.25 
 
 
433 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  44.63 
 
 
420 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 
412 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  39.95 
 
 
392 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 
449 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 
862 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  35.84 
 
 
309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 
363 aa  127  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.69 
 
 
381 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 
576 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 
446 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.87 
 
 
447 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.49 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.4 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.67 
 
 
440 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.04 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  33.7 
 
 
408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  30.75 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.72 
 
 
1191 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30.59 
 
 
320 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 
333 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.19 
 
 
450 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.77 
 
 
311 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30.86 
 
 
483 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
447 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 
309 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  31.5 
 
 
340 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 
401 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 
401 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 
412 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.78 
 
 
389 aa  104  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.5 
 
 
286 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 
351 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.13 
 
 
319 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  35.04 
 
 
521 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
567 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 
442 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.55 
 
 
517 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.82 
 
 
386 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 
264 aa  96.7  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.45 
 
 
870 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 
515 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
343 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
489 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
343 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.79 
 
 
872 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 
295 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  28.88 
 
 
278 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.07 
 
 
234 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.96 
 
 
266 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  36.52 
 
 
277 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  35.77 
 
 
216 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.42 
 
 
227 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 
312 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 
214 aa  86.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.79 
 
 
14916 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.1 
 
 
225 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 
268 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.85 
 
 
262 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  36.11 
 
 
710 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  28.85 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
727 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.96 
 
 
745 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.77 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.01 
 
 
844 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.03 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  38 
 
 
1033 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  35.03 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.86 
 
 
866 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.3 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.83 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  32.45 
 
 
776 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.98 
 
 
215 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  33.16 
 
 
300 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  23.6 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  35.16 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  30.55 
 
 
231 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  37.2 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  32.76 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 
259 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  38.41 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  34.44 
 
 
706 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.55 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  27.06 
 
 
432 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  41.46 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  32.39 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  30.8 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  19.57 
 
 
607 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.6 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>