More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1956 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 219 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  66.83 
 
 		 215 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  64.95 
 
 		 217 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  65.3 
 
 		 219 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  64.86 
 
 		 219 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  70.74 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 567 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.49 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40.43 
 
 		 903 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.16 
 
 		 381 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  40.95 
 
 		 493 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 		 291 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  40.34 
 
 		 517 aa  94  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.04 
 
 		 1033 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.74 
 
 		 286 aa  92.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  42.68 
 
 		 449 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 		 295 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.34 
 
 		 386 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 309 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.54 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 440 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.01 
 
 		 489 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  44.22 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.26 
 
 		 745 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 		 294 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 		 384 aa  88.6  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 		 343 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.2 
 
 		 343 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  35.47 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  42.03 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  35.84 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  40.12 
 
 		 319 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  38.67 
 
 		 448 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.14 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 521 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  36.95 
 
 		 412 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.6 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 333 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.67 
 
 		 332 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 		 340 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.96 
 
 		 320 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  42.08 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.53 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.88 
 
 		 416 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 		 419 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  35.53 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  43.61 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.26 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  42.04 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  31.28 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  42.04 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.33 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  34.97 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  33.9 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 		 485 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 576 aa  79  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 734 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.58 
 
 		 351 aa  78.6  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.14 
 
 		 862 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  37.79 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.71 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  36.75 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 1831 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  33.74 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  36.26 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.18 
 
 		 483 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.5 
 
 		 408 aa  76.3  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  41.43 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  37.35 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  41.43 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.43 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  34.91 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.73 
 
 		 1191 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  37.58 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  40.78 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 408 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>