More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0289 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  44.86 
 
 
243 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 
260 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  40.84 
 
 
218 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.29 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
210 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  39.44 
 
 
416 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  39.55 
 
 
195 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
357 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 
449 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  47.65 
 
 
309 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  47.5 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  43.14 
 
 
241 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 
262 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 
432 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.77 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.53 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 
441 aa  97.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.3 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.28 
 
 
332 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  43.27 
 
 
576 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.92 
 
 
356 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  45.95 
 
 
745 aa  95.5  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.72 
 
 
340 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 
412 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.59 
 
 
386 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  49.23 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  40.34 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
903 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  36.41 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.82 
 
 
381 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  44.9 
 
 
521 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  32.81 
 
 
300 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
336 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  38.05 
 
 
319 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
336 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 
206 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
1033 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.02 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
343 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  46.15 
 
 
493 aa  90.5  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  43.05 
 
 
227 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
333 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.82 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 
351 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  44.68 
 
 
184 aa  88.6  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  41.36 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.05 
 
 
216 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  41.36 
 
 
215 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 
420 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  46.71 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  42.95 
 
 
234 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  41.36 
 
 
217 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  43.27 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 
517 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 
567 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.14 
 
 
448 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 
446 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  43.27 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  41.36 
 
 
219 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  43.87 
 
 
311 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.65 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  41.88 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.42 
 
 
213 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  37.16 
 
 
447 aa  86.3  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 
515 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 
973 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  44.3 
 
 
489 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 
213 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  41.36 
 
 
219 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  42.33 
 
 
184 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 
433 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 
174 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  39.31 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  39.88 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  42.96 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  36.41 
 
 
734 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  42.96 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  45.19 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
862 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  36.09 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  42.18 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  44.23 
 
 
727 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  44.88 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  35.43 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  43.8 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  40.82 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 
199 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.12 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  36.95 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 
259 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.98 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.34 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>