More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3446 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  39.11 
 
 		 264 aa  99  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 262 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 		 300 aa  98.6  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.73 
 
 		 447 aa  97.8  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 243 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 262 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 		 576 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 		 295 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 		 279 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.55 
 
 		 279 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 268 aa  92  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.33 
 
 		 213 aa  91.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  35.09 
 
 		 412 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 		 446 aa  89.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 		 432 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.85 
 
 		 286 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.11 
 
 		 525 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 408 aa  88.6  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  43.75 
 
 		 277 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  34.66 
 
 		 450 aa  87.8  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  45.6 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 449 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 		 332 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 320 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  42.76 
 
 		 309 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 356 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  45 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 1033 aa  86.3  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 973 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.84 
 
 		 381 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  37.14 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 489 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 		 356 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  32.37 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.64 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 442 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 567 aa  81.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  41.35 
 
 		 734 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 		 862 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  40.14 
 
 		 433 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  28.2 
 
 		 285 aa  81.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.11 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  39.77 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.8 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.29 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  38.03 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  34.32 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.01 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  32.32 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 		 727 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  35.76 
 
 		 745 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.79 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.14 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.78 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  40.51 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 		 483 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  43.41 
 
 		 416 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.25 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  38.46 
 
 		 776 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  38.76 
 
 		 493 aa  78.6  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.68 
 
 		 600 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 343 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.02 
 
 		 343 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.76 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 448 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  37.67 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.43 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  44.76 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.87 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  42.75 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.56 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  47.27 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  39.71 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  43.18 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  42.25 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  38.66 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  35.22 
 
 		 420 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>