More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0198 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 862 aa  1725    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  43.33 
 
 		 775 aa  270  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 917 aa  243  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  35.33 
 
 		 581 aa  220  7e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 		 1140 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 833 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  40.33 
 
 		 1063 aa  218  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 793 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.49 
 
 		 1054 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 1019 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  38.1 
 
 		 794 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.08 
 
 		 449 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  36.27 
 
 		 758 aa  211  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 1191 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 		 1151 aa  208  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 1246 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 389 aa  205  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.5 
 
 		 882 aa  203  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  37.34 
 
 		 835 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  34.78 
 
 		 988 aa  197  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  34.73 
 
 		 580 aa  197  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.25 
 
 		 916 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  38.11 
 
 		 757 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.84 
 
 		 1121 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  33.63 
 
 		 779 aa  190  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.31 
 
 		 822 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.49 
 
 		 856 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 		 1191 aa  178  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1309 aa  177  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 898 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  30.77 
 
 		 728 aa  169  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.5 
 
 		 381 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 962 aa  167  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1050 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  33.23 
 
 		 606 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 		 576 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 517 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.17 
 
 		 336 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.17 
 
 		 336 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2313  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.16 
 
 		 981 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.762814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 842 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 867 aa  157  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 		 309 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1101 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.02 
 
 		 311 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.84 
 
 		 493 aa  155  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 868 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 774 aa  153  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.88 
 
 		 448 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.45 
 
 		 319 aa  150  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 		 483 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.73 
 
 		 333 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  30.57 
 
 		 785 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.25 
 
 		 401 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1039 aa  146  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 		 401 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  27.78 
 
 		 596 aa  144  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 		 332 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 802 aa  142  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 		 419 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 		 320 aa  140  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.56 
 
 		 450 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  30.93 
 
 		 440 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 685 aa  134  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 401 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 401 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  29.39 
 
 		 1041 aa  132  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.21 
 
 		 286 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.96 
 
 		 351 aa  132  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  33.45 
 
 		 340 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.71 
 
 		 412 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.2 
 
 		 408 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.71 
 
 		 447 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  37.96 
 
 		 264 aa  126  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  31.23 
 
 		 420 aa  127  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  22.62 
 
 		 601 aa  125  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 		 776 aa  125  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  26.45 
 
 		 617 aa  124  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  22.85 
 
 		 635 aa  124  9e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 		 343 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 567 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.81 
 
 		 343 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.59 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.78 
 
 		 493 aa  121  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  31.51 
 
 		 432 aa  121  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.87 
 
 		 515 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.29 
 
 		 14916 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.36 
 
 		 291 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 294 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.36 
 
 		 291 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  37.9 
 
 		 386 aa  118  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 936 aa  118  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.07 
 
 		 489 aa  118  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1049 aa  117  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.97 
 
 		 918 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 		 446 aa  117  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.63 
 
 		 295 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.88 
 
 		 441 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>