More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2673 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 219 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  94.52 
 
 		 219 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  97.72 
 
 		 219 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  67.33 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  63.11 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  65.43 
 
 		 217 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.21 
 
 		 309 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  41.4 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  41.38 
 
 		 381 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 567 aa  99.8  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.96 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.36 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.37 
 
 		 489 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  91.7  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 521 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.29 
 
 		 903 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 343 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 		 332 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.57 
 
 		 343 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.72 
 
 		 319 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.1 
 
 		 441 aa  88.2  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 		 336 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 449 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  38.01 
 
 		 336 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.07 
 
 		 386 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 214 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  44.97 
 
 		 745 aa  86.7  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 279 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.87 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  40.34 
 
 		 483 aa  85.1  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  41.72 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  36.36 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.64 
 
 		 517 aa  84.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  35.2 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.96 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.72 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.84 
 
 		 525 aa  81.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 320 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  36.32 
 
 		 734 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  44.37 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  34.13 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.89 
 
 		 1033 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  34.34 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  34.66 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 389 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  34.78 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 		 485 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  35.18 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  38.75 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.71 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  34.52 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  45.99 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.65 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.99 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  41.42 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  41.29 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.75 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  43.4 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  39.87 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 		 776 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 		 416 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  32.96 
 
 		 710 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.83 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  34.09 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  38.95 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  38.07 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38.33 
 
 		 727 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>