More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1048 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 420 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  52.78 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  50.12 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  43.57 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  38.19 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  36.05 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 446 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.69 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.44 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.5 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  30.95 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.09 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  29.23 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.49 
 
 		 449 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.48 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.31 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.73 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  28.37 
 
 		 264 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  26.15 
 
 		 1191 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 862 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  35.87 
 
 		 218 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.25 
 
 		 515 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 260 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  28.65 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  27.02 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 825 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 825 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 825 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 862 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  29.62 
 
 		 825 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.47 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 		 825 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.83 
 
 		 870 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 279 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.47 
 
 		 277 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 		 567 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 279 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.75 
 
 		 225 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 213 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  30.41 
 
 		 483 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 825 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  37.42 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.64 
 
 		 184 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.56 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  36.13 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.67 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.49 
 
 		 844 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  37.85 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.42 
 
 		 745 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  28.75 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  30.91 
 
 		 776 aa  83.2  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.29 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  29.52 
 
 		 872 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  33.94 
 
 		 263 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.82 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  32.98 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  30.79 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4971  pentapeptide repeat protein  38.67 
 
 		 165 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  28.49 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  28.1 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  28.1 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.05 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.85 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  35.67 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  34.74 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.81 
 
 		 949 aa  80.5  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.93 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  33.75 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 903 aa  79.7  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  30.16 
 
 		 355 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.25 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.17 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  30.69 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  29.66 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  27.3 
 
 		 886 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.16 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  37.59 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.16 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>