More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1237 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
438 aa  873    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  44.69 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  46.39 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  43.57 
 
 
420 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  39.76 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  37.72 
 
 
393 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.55 
 
 
447 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  32.4 
 
 
408 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 
442 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 
450 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  28.98 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  29.87 
 
 
389 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 
449 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.8 
 
 
440 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.02 
 
 
381 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 
401 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.38 
 
 
401 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.19 
 
 
333 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  30.19 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 
862 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.97 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  31.14 
 
 
309 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.41 
 
 
300 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  40.82 
 
 
234 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.64 
 
 
299 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 
363 aa  87  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  52.27 
 
 
260 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 
456 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  31.15 
 
 
392 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
1191 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  31.02 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  38.73 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.87 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.96 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  43.84 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  28.12 
 
 
576 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 
881 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  37.95 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  29.33 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  37.93 
 
 
309 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.73 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.47 
 
 
336 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.15 
 
 
213 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  42.17 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 
493 aa  78.6  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  37.42 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  46.88 
 
 
973 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  41.4 
 
 
433 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  30.14 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.31 
 
 
222 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.24 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  39.74 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.47 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 
521 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  32.96 
 
 
210 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.22 
 
 
184 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  44.04 
 
 
194 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.08 
 
 
517 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.1 
 
 
745 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  27.47 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  32.53 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  42.5 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.8 
 
 
483 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  32.53 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  32.53 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7498  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.24 
 
 
268 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  35.23 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  55.81 
 
 
206 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  35.29 
 
 
291 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  55.81 
 
 
206 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.84 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0205  serine/threonine protein kinase with pentapeptide repeats  42.71 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.47043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.95 
 
 
525 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.73 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>