More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1231 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 363 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.13 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  32.09 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  32.06 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  33.52 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  31.55 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  32.44 
 
 		 521 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  32.17 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.39 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.39 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  30.03 
 
 		 576 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  30 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.19 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  31.39 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.04 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 517 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  35.9 
 
 		 214 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.29 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  30.29 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.49 
 
 		 234 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.56 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  32.8 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 		 213 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 483 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 862 aa  95.5  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  27.3 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  26.17 
 
 		 448 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  30.04 
 
 		 776 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.11 
 
 		 903 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  27.13 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 		 359 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 515 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  29.68 
 
 		 264 aa  90.5  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 		 452 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 		 441 aa  89.7  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  27.49 
 
 		 567 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30.58 
 
 		 294 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 1033 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  28.8 
 
 		 351 aa  89.4  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  26.62 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.69 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.31 
 
 		 870 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.52 
 
 		 340 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  34.07 
 
 		 278 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.18 
 
 		 14916 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  38.55 
 
 		 485 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  36.93 
 
 		 453 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  29 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  26.32 
 
 		 600 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  28.41 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  30.98 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  28.93 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.61 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.73 
 
 		 844 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  28.93 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  27.41 
 
 		 734 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  29.85 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  26.01 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25.53 
 
 		 949 aa  83.2  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1191 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  27.37 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  31.52 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  31.01 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  26.46 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  34.64 
 
 		 175 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  31.67 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  28.77 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.58 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  32.39 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  30.24 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  30.6 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  34.94 
 
 		 215 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  31.58 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  30.54 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.69 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  34.67 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>