More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0030 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 359 aa  729    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 348 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  28.02 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2442  pentapeptide repeat protein  28.73 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  24.02 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  24.32 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.1 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  26.28 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  26.46 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 360 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  24.28 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  24.28 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  24.28 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  24.28 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.15 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.42 
 
 		 949 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  24.02 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.29 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  26.93 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  26.93 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  26.1 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  27.27 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  24.58 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.69 
 
 		 844 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.94 
 
 		 493 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 521 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 		 363 aa  92.8  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.57 
 
 		 862 aa  92.8  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  26.76 
 
 		 846 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  23.62 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.81 
 
 		 976 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  26.51 
 
 		 870 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  26.07 
 
 		 576 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  26.03 
 
 		 311 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  25.08 
 
 		 448 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  23.12 
 
 		 886 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  21.36 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  21.36 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  23.57 
 
 		 872 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  23.92 
 
 		 825 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.22 
 
 		 825 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  23.7 
 
 		 881 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  27.57 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.84 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.17 
 
 		 825 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  24.92 
 
 		 877 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  24.66 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  23.6 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 880 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 880 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  24.43 
 
 		 880 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  23.72 
 
 		 866 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  27 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  26.69 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  24.16 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  26.04 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.23 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  25.35 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  25.66 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  25.38 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  23.25 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  22.09 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  22.58 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  27.55 
 
 		 242 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 312 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.15 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  21.13 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  25.09 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 567 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  26.57 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  25.84 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.09 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  22.57 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.73 
 
 		 14916 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  23.93 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  23.92 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  26.74 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  22.57 
 
 		 401 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  23.68 
 
 		 446 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>