More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3276 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
319 aa  623  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  45.71 
 
 
333 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 
336 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  44.94 
 
 
336 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.31 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  45.57 
 
 
449 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  38.37 
 
 
381 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 
309 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 
862 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41 
 
 
311 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  41.88 
 
 
286 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 
320 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  37.26 
 
 
521 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  39.47 
 
 
576 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 
340 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 
214 aa  140  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
401 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
401 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
448 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 
343 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  35.62 
 
 
343 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 
295 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  42.92 
 
 
386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 
351 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  41.78 
 
 
234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 
1191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  34.44 
 
 
440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.24 
 
 
401 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.24 
 
 
401 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  32.95 
 
 
450 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.31 
 
 
489 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 
483 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  32.31 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 
237 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.27 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.11 
 
 
493 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  41.07 
 
 
227 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43 
 
 
213 aa  119  7e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  39.15 
 
 
268 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.82 
 
 
745 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.23 
 
 
776 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 
515 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  38.58 
 
 
239 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  33.11 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  37.74 
 
 
493 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  38.65 
 
 
567 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 
408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 
184 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.32 
 
 
216 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.17 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 
412 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39.04 
 
 
219 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 
309 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.7 
 
 
189 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.53 
 
 
441 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  28.81 
 
 
442 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  34.54 
 
 
734 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.34 
 
 
225 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  31.03 
 
 
363 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  37.36 
 
 
187 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  43.11 
 
 
234 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  30.82 
 
 
348 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  43.11 
 
 
234 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
182 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.37 
 
 
225 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 
266 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  30.18 
 
 
846 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 
446 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  33.21 
 
 
262 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.86 
 
 
870 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33.21 
 
 
262 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.24 
 
 
278 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  37.56 
 
 
213 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  31.13 
 
 
419 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.33 
 
 
420 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.31 
 
 
184 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  37.13 
 
 
312 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  40.88 
 
 
182 aa  99.4  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  33.47 
 
 
231 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.74 
 
 
1033 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 
949 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  37.44 
 
 
273 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  43.58 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 
204 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.21 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  29.97 
 
 
447 aa  97.8  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  35.55 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  41.14 
 
 
416 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.1 
 
 
872 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.88 
 
 
447 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 
635 aa  96.7  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  40.85 
 
 
277 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 
880 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 
880 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 
872 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  32.24 
 
 
880 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>