More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1486 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  54.59 
 
 
234 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  49 
 
 
381 aa  189  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  52.68 
 
 
286 aa  174  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  48.77 
 
 
493 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  43.1 
 
 
489 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  53.85 
 
 
362 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  54.67 
 
 
168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  46.64 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.3 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  48.07 
 
 
521 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  46.89 
 
 
214 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  45.79 
 
 
386 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  48.09 
 
 
517 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  46.43 
 
 
745 aa  123  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.41 
 
 
567 aa  122  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  43.56 
 
 
294 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  45.7 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  47.89 
 
 
449 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  45.41 
 
 
267 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  46.67 
 
 
291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.45 
 
 
320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.21 
 
 
213 aa  118  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  44.5 
 
 
333 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.5 
 
 
332 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  44.33 
 
 
441 aa  116  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  43.58 
 
 
734 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  47.18 
 
 
311 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  41.74 
 
 
340 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  46.2 
 
 
776 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
336 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
336 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  45.9 
 
 
278 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  45.4 
 
 
576 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  48.55 
 
 
351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  45 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  45.92 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  41.75 
 
 
268 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
448 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 
309 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  43.64 
 
 
189 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  43.58 
 
 
343 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  43.58 
 
 
343 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  43.63 
 
 
416 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 
241 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.14 
 
 
312 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  43.37 
 
 
319 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  41.4 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  37.98 
 
 
366 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
389 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  48.2 
 
 
384 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  38.65 
 
 
285 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  40.44 
 
 
493 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  37.96 
 
 
366 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
263 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
408 aa  102  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  37.68 
 
 
350 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  43.56 
 
 
483 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  48.7 
 
 
184 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38.74 
 
 
433 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  39.69 
 
 
300 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  40.86 
 
 
219 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.89 
 
 
525 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.27 
 
 
401 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  38.1 
 
 
600 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  43.71 
 
 
299 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 
225 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  44 
 
 
450 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  45.39 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  41.49 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  36.06 
 
 
366 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  41.15 
 
 
903 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  37.86 
 
 
401 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  52.17 
 
 
900 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  40.62 
 
 
262 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  36.06 
 
 
366 aa  98.6  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
259 aa  98.2  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  40.32 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 
485 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  42.05 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  40.38 
 
 
381 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.71 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 
401 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 
452 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.55 
 
 
1033 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  44.64 
 
 
401 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  44.08 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  43.5 
 
 
295 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.2 
 
 
862 aa  95.9  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  43.65 
 
 
219 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  44.72 
 
 
447 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  39.89 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  38.94 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  36.7 
 
 
515 aa  95.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 
250 aa  94.7  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  41.52 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  36.46 
 
 
440 aa  95.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>