More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0209 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 446 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  55.78 
 
 		 450 aa  472  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  49.32 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  39.27 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  38.99 
 
 		 408 aa  285  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  38.19 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.36 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  30.31 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  29.18 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  31.7 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  30.31 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.68 
 
 		 401 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.73 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.68 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.33 
 
 		 332 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  29.98 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  34.37 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.74 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  32.06 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  32.06 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  34.45 
 
 		 311 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.85 
 
 		 862 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  34.43 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 483 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.2 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.21 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.48 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.48 
 
 		 336 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  38 
 
 		 356 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.93 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  38 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  31.13 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1191 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  42.77 
 
 		 567 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  30.28 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.84 
 
 		 343 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.63 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.12 
 
 		 844 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  31.27 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.58 
 
 		 576 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  44.51 
 
 		 245 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.82 
 
 		 489 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  39.49 
 
 		 263 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  28.44 
 
 		 872 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.62 
 
 		 745 aa  97.8  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  32.07 
 
 		 294 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40.37 
 
 		 264 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 386 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  43.8 
 
 		 213 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.9 
 
 		 234 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.6 
 
 		 517 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.03 
 
 		 872 aa  96.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 260 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  36.23 
 
 		 210 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.42 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.35 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.11 
 
 		 320 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  46.26 
 
 		 214 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.8 
 
 		 216 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 521 aa  94.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  44.67 
 
 		 225 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 		 268 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  39.33 
 
 		 260 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  42.55 
 
 		 776 aa  93.2  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  46.21 
 
 		 277 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 825 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 825 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 825 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  27.89 
 
 		 862 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  47.22 
 
 		 900 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  37.65 
 
 		 243 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 176 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  44.27 
 
 		 180 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2673  serine/threonine protein kinase  42.14 
 
 		 533 aa  92.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  45.86 
 
 		 182 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 176 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.72 
 
 		 515 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.99 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 880 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  48.51 
 
 		 1033 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 241 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 225 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  27.22 
 
 		 877 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  35.5 
 
 		 206 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  44.7 
 
 		 182 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  26.91 
 
 		 880 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  49.21 
 
 		 256 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>