More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1212 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
420 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  44.63 
 
 
419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  45.61 
 
 
433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  43.6 
 
 
412 aa  262  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 
392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  34.39 
 
 
449 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.23 
 
 
862 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  28.4 
 
 
448 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  31.97 
 
 
381 aa  123  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  34.56 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.89 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 
311 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.62 
 
 
447 aa  113  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 
340 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.62 
 
 
401 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 
401 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  31.49 
 
 
351 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.57 
 
 
401 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 
1191 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.59 
 
 
493 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.35 
 
 
401 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 
320 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 
440 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.79 
 
 
576 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 
343 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.65 
 
 
332 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 
343 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.44 
 
 
286 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  34.43 
 
 
521 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 
446 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  30.19 
 
 
389 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  29.5 
 
 
483 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 
336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 
336 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.33 
 
 
319 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  29.06 
 
 
333 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 
450 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  34.85 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  31.25 
 
 
234 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  34.56 
 
 
278 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.07 
 
 
309 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.39 
 
 
517 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 
567 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.71 
 
 
600 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  30.21 
 
 
493 aa  93.2  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
880 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
880 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  35 
 
 
734 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  34.54 
 
 
489 aa  93.2  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
294 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  34.29 
 
 
870 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
880 aa  93.2  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
880 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 
515 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 
877 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
268 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  36.24 
 
 
214 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 
776 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  34.02 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.53 
 
 
264 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  23.2 
 
 
607 aa  91.3  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  28.76 
 
 
442 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  30.62 
 
 
880 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 
273 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  27.33 
 
 
949 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  32.75 
 
 
225 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  33.01 
 
 
295 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  32.18 
 
 
872 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  33 
 
 
262 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  40.54 
 
 
456 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  36.45 
 
 
216 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  32.06 
 
 
881 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  36.77 
 
 
266 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 
199 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  31.8 
 
 
285 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  36.87 
 
 
452 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  40 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1328  pentapeptide repeat protein  25.87 
 
 
929 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000290536  hitchhiker  0.0000145927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  31.66 
 
 
872 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  29.32 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  34.48 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
291 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.67 
 
 
14916 aa  84.3  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  34.6 
 
 
903 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.23 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  28.36 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  34.41 
 
 
176 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  34.41 
 
 
176 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  34.98 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>