More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1286 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 
309 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.97 
 
 
449 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.88 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.74 
 
 
381 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
264 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 
521 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  38.07 
 
 
241 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.01 
 
 
493 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 
227 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  35.95 
 
 
489 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  37.39 
 
 
332 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  34.96 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  34.96 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  34.04 
 
 
734 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  37.57 
 
 
441 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  39.23 
 
 
203 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.19 
 
 
267 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.02 
 
 
576 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  31.15 
 
 
294 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.39 
 
 
386 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  36.32 
 
 
286 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  35.35 
 
 
567 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  36.41 
 
 
219 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
268 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.52 
 
 
319 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  33.33 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  38.41 
 
 
210 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  33.05 
 
 
333 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 
448 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.9 
 
 
350 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 
233 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.12 
 
 
416 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.19 
 
 
214 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 
233 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 
259 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  33.9 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.56 
 
 
225 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  34.33 
 
 
320 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.04 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  42.08 
 
 
216 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.38 
 
 
862 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  32.48 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
262 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
262 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 
517 aa  86.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  32.77 
 
 
366 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  39.04 
 
 
182 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 
870 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  32.77 
 
 
366 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  33.01 
 
 
844 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.07 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  36.95 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  37.16 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  32.17 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  34.6 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.22 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  32.7 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  35.82 
 
 
199 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  34.19 
 
 
483 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  30.29 
 
 
600 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  32.83 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.35 
 
 
182 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  40.09 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.87 
 
 
1033 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.46 
 
 
1191 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  31.22 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  35.8 
 
 
189 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  37.21 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  32.95 
 
 
710 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  38.06 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  33.33 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  36.56 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  36.27 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  32.86 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  32.86 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  32.86 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  33.6 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  32.86 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  37.7 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  32.89 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.85 
 
 
263 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.51 
 
 
525 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.32 
 
 
278 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  30.65 
 
 
976 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  30 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  38.25 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>