More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2556 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 776 aa  1538    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  53.76 
 
 		 745 aa  140  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  44.83 
 
 		 567 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  37.8 
 
 		 381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  42.39 
 
 		 493 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 		 517 aa  127  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.97 
 
 		 333 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  35.85 
 
 		 862 aa  124  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 449 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  39.29 
 
 		 521 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.52 
 
 		 309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.77 
 
 		 286 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  42.8 
 
 		 433 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  43.28 
 
 		 441 aa  120  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.28 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40.56 
 
 		 340 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  49.72 
 
 		 416 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.6 
 
 		 576 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  53.97 
 
 		 614 aa  116  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 351 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  46.2 
 
 		 225 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.41 
 
 		 311 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  42.65 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.98 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 1191 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  41.42 
 
 		 366 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.27 
 
 		 448 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 		 268 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  47.72 
 
 		 216 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.85 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.54 
 
 		 332 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  35.91 
 
 		 264 aa  108  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  39.57 
 
 		 320 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 		 408 aa  107  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  41.42 
 
 		 350 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  36.04 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  39.64 
 
 		 366 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 278 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  33.6 
 
 		 294 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 266 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 386 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  37.24 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  35.05 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  36.76 
 
 		 366 aa  102  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  36.76 
 
 		 366 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  36.54 
 
 		 515 aa  102  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  33.21 
 
 		 291 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  46.15 
 
 		 184 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 343 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  36.21 
 
 		 343 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.77 
 
 		 291 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 		 401 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  39.41 
 
 		 237 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 		 285 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  39.59 
 
 		 903 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 300 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  34.54 
 
 		 600 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  32.01 
 
 		 412 aa  97.8  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  38.25 
 
 		 295 aa  97.8  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  35.21 
 
 		 870 aa  97.4  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  47.4 
 
 		 1033 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.14 
 
 		 485 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  44.12 
 
 		 381 aa  95.9  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  42.02 
 
 		 203 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  30.04 
 
 		 363 aa  94.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.33 
 
 		 312 aa  94.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  37.63 
 
 		 213 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.55 
 
 		 446 aa  94  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  36.29 
 
 		 262 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  38.31 
 
 		 452 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  35.19 
 
 		 262 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  39.9 
 
 		 273 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.37 
 
 		 263 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.01 
 
 		 607 aa  92.4  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  42.75 
 
 		 412 aa  91.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  32.79 
 
 		 420 aa  91.7  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 525 aa  91.3  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.32 
 
 		 277 aa  91.3  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  35.41 
 
 		 872 aa  90.9  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 450 aa  90.9  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  39.46 
 
 		 218 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  39.64 
 
 		 215 aa  90.5  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  34.38 
 
 		 225 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  36.62 
 
 		 231 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.5 
 
 		 204 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 		 440 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  36.87 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  19.84 
 
 		 635 aa  89  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.13 
 
 		 241 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  35.39 
 
 		 309 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  35.38 
 
 		 267 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  31.84 
 
 		 710 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.08 
 
 		 872 aa  88.2  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  44.25 
 
 		 299 aa  87.8  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32.27 
 
 		 880 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>