More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1275 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
213 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  44.5 
 
 
309 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 
449 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.73 
 
 
311 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 
567 aa  108  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 
343 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  42.35 
 
 
343 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 
264 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  39.62 
 
 
332 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
336 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  40.09 
 
 
336 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  40.51 
 
 
351 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.96 
 
 
389 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.84 
 
 
576 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  40.48 
 
 
333 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  43.35 
 
 
291 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.86 
 
 
381 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  43.35 
 
 
291 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  42.78 
 
 
286 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40.95 
 
 
320 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 
294 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  41.62 
 
 
489 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  41.21 
 
 
386 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  37.56 
 
 
319 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 
521 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  39.39 
 
 
267 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 
340 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  39.71 
 
 
493 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.42 
 
 
862 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 
300 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.63 
 
 
416 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  42.7 
 
 
241 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.82 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  41.84 
 
 
441 aa  97.8  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  42.05 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  40.45 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  39.15 
 
 
448 aa  96.7  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  45.03 
 
 
182 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.53 
 
 
517 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
903 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.23 
 
 
776 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 
440 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  42.04 
 
 
182 aa  95.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  37.26 
 
 
234 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.59 
 
 
268 aa  94.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 
250 aa  94  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.29 
 
 
1033 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  45.99 
 
 
256 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
483 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
515 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.76 
 
 
285 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  34.31 
 
 
452 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.02 
 
 
184 aa  91.7  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_002978  WD0440  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 
601 aa  91.3  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.17 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  37.16 
 
 
745 aa  90.9  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  29.49 
 
 
607 aa  91.3  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  40.34 
 
 
734 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.69 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2330  pentapeptide repeat protein  38.33 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  45.16 
 
 
277 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38.15 
 
 
727 aa  88.6  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.56 
 
 
278 aa  88.2  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  36.73 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  38.66 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  39.06 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  40.88 
 
 
412 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  36.23 
 
 
493 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  34.54 
 
 
262 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  34.54 
 
 
262 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  35.67 
 
 
366 aa  85.5  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
401 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
401 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  41.5 
 
 
263 aa  85.1  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  36.28 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  36.28 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  41.95 
 
 
401 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 
174 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  34.5 
 
 
350 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  43.38 
 
 
447 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  41.13 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.53 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  39.05 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  36.51 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
384 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.56 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  43.61 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  41.76 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  40.4 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.13 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  42.47 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  42.47 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>