More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1582 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 299 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  50.91 
 
 		 1033 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  46.45 
 
 		 449 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 		 973 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  45.96 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  46.29 
 
 		 214 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  49.7 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.88 
 
 		 184 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  41.38 
 
 		 862 aa  105  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  37.63 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 		 517 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  36.55 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 		 216 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  46.71 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  40.87 
 
 		 332 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  43.71 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 567 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.73 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  33.99 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  43.11 
 
 		 264 aa  99.4  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  40.59 
 
 		 408 aa  99.4  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 576 aa  99  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  48.47 
 
 		 745 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  43.58 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  41.44 
 
 		 351 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  43.02 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.73 
 
 		 401 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  37.68 
 
 		 266 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  34.7 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.8 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 340 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  41.03 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.36 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.48 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.8 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  45.89 
 
 		 727 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  41.92 
 
 		 203 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.2 
 
 		 521 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.5 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.84 
 
 		 199 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  38.31 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  37.84 
 
 		 419 aa  92.4  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  39.71 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  45.15 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.93 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.93 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  40.31 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  41.04 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.55 
 
 		 14916 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  41.46 
 
 		 204 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  40.49 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.76 
 
 		 525 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  42.17 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  40.2 
 
 		 441 aa  89.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  40.64 
 
 		 438 aa  89  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  38.81 
 
 		 870 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 447 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  44.25 
 
 		 776 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 		 903 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.8 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  42.01 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  34.65 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  34.65 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  42.56 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  42.38 
 
 		 174 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  41.78 
 
 		 614 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.4 
 
 		 433 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 222 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  40.33 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  42.56 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  33.51 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 222 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.15 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  38.69 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.86 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  36.67 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  37.21 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  36.52 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  42 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  32.76 
 
 		 734 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  43.92 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  33.85 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  37.1 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  36.9 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>