More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1451 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 525 aa  1069    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  44.24 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 567 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  39.78 
 
 		 214 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.35 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  41.21 
 
 		 309 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 		 206 aa  102  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  41.36 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  40.11 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.89 
 
 		 225 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  40 
 
 		 267 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  39.58 
 
 		 234 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40 
 
 		 286 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  37.02 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 		 241 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.63 
 
 		 343 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.63 
 
 		 343 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.68 
 
 		 227 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  37.91 
 
 		 216 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 332 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  38.02 
 
 		 449 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.22 
 
 		 521 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  45.45 
 
 		 340 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.15 
 
 		 517 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 		 225 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  39.89 
 
 		 448 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40.91 
 
 		 745 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.13 
 
 		 333 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.06 
 
 		 189 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  36.42 
 
 		 366 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  38.54 
 
 		 266 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  33.81 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  39.63 
 
 		 734 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 776 aa  91.3  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  31.76 
 
 		 299 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  39.87 
 
 		 366 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.81 
 
 		 320 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 		 291 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  35.64 
 
 		 366 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.74 
 
 		 263 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  36.99 
 
 		 366 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  36.26 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 203 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  49.11 
 
 		 206 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.29 
 
 		 291 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  37.37 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  39.87 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  41.1 
 
 		 168 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  32.72 
 
 		 433 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  35.68 
 
 		 319 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  39.26 
 
 		 295 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  41.04 
 
 		 264 aa  87.4  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 		 389 aa  87  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  40.14 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.68 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  43.41 
 
 		 1033 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  35.18 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  36.63 
 
 		 184 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  39.08 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  42.76 
 
 		 706 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  48.72 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  37.93 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  40.8 
 
 		 900 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  33.51 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  31.82 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  31.11 
 
 		 254 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  37.95 
 
 		 309 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 		 903 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  41.1 
 
 		 175 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  32.9 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  35.67 
 
 		 259 aa  83.2  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 		 384 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  38.79 
 
 		 180 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  41.96 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  35.48 
 
 		 215 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  37.85 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  39.87 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.98 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  35.48 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  37.59 
 
 		 182 aa  80.9  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 862 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  45.3 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  36.22 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  45.3 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2409  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 		 885 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.65 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  32 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  38.19 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4086  pentapeptide repeat-containing protein  32.13 
 
 		 1003 aa  79.7  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.791775  normal  0.807746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  31.64 
 
 		 600 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>