More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2891 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  100 
 
 
350 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  90 
 
 
366 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  93.71 
 
 
366 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  92.86 
 
 
366 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  90.29 
 
 
366 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  34.1 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  33.33 
 
 
291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  33.33 
 
 
291 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  33.33 
 
 
291 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1047  secreted effector protein  32.95 
 
 
291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  42.86 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.03 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  43.27 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.37 
 
 
386 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.68 
 
 
234 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  41.42 
 
 
776 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
567 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  36.98 
 
 
745 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  39.18 
 
 
489 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  35.61 
 
 
517 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  37.68 
 
 
225 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 
309 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.23 
 
 
381 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  35.6 
 
 
493 aa  99.8  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 
343 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  42.2 
 
 
1033 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34 
 
 
448 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  40.46 
 
 
343 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  37.43 
 
 
576 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 
332 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  34.93 
 
 
259 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  33.18 
 
 
441 aa  95.9  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  38.21 
 
 
333 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 
336 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.92 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  37.57 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  36.87 
 
 
521 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  37.85 
 
 
218 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  38.86 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  37.7 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.22 
 
 
216 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  41.18 
 
 
213 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.94 
 
 
401 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 
245 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  34.26 
 
 
241 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 
389 aa  90.1  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
710 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.76 
 
 
862 aa  89.7  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.9 
 
 
412 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  39.77 
 
 
340 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  33.48 
 
 
483 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.34 
 
 
401 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.06 
 
 
268 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.87 
 
 
525 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  35.75 
 
 
515 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.09 
 
 
319 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  40.35 
 
 
214 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  36.22 
 
 
239 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 
189 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  35.08 
 
 
295 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.7 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  36.46 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 
222 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  34.5 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  39.58 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  35.68 
 
 
184 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  35.58 
 
 
706 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.89 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  37.44 
 
 
433 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  33.49 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.33 
 
 
734 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.32 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  34.42 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  35.29 
 
 
1191 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  34.01 
 
 
727 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  38.78 
 
 
384 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.42 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  35.98 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  32.43 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  40.56 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  37.11 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.26 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  35.42 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.5 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  40.28 
 
 
446 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  38.96 
 
 
182 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  36.49 
 
 
903 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  36.52 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>